RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.46□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 IGKCP01834 107 aa9.45□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 UBE2BP63146 152 aa9.45□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 SFTA2Q6UW10 78 aa9.45□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.44□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.42□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 LEPROTO15243 131 aa9.41□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.41□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.4□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 C5orf52A6NGY3 159 aa9.4□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 S100A6P06703 90 aa9.4□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 KRTDAPP60985 99 aa9.4□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.4□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 HERVK_113P61574 105 aa9.39□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 COX17Q14061 63 aa9.39□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 ERG28Q9UKR5 140 aa9.39□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 E9PLD3 99 aa9.38□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.38□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.38□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 J3QQQ9 107 aa9.37□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 S100A2P29034 98 aa9.37□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 HERV-K104P63124 156 aa9.37□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 C22orf24Q9Y442 160 aa9.37□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 C20orf202A1L168 122 aa9.36□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 NMUP48645 174 aa9.36□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.35□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 AKR1D1P51857 326 aa9.35□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF861PO60384 105 aa9.34□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 PFN2P35080 140 aa9.34□□□□□ -0.91
KCNQ1-206ENST00000526095 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.33□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.33□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.32□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.31□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 LINC00587B1AMM8 73 aa9.31□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 SMIM13P0DJ93 91 aa9.3□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 LINC00158P58513 81 aa9.29□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 PRR4Q16378 134 aa9.29□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.28□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 VPREB1P12018 145 aa9.28□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.28□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.28□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 ATOH7Q8N100 152 aa9.28□□□□□ -0.92
KCNQ1-206ENST00000526095 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A0J9YXY3 114 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 BCE1O60756 84 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 Q8NDZ9 215 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 LINC00167Q96N53 147 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A087X002 238 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 GAGE10A6NGK3 116 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A0U1RRA0 63 aa9.25□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 TSPAN13O95857 204 aa9.25□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 TIMM17BO60830 172 aa9.24□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 LITAFQ99732 161 aa9.24□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.24□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF815PA8K554 130 aa9.23□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.22□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.22□□□□□ -0.93
KCNQ1-206ENST00000526095 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.21□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 DAND5Q8N907 189 aa9.21□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.21□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 SCGB1D1O95968 90 aa9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 CRYGAP11844 174 aa9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 PCP2Q8IVA1 136 aa9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 MUC2Q02817 5179 aa9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.19□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.19□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 UBE2AP49459 152 aa9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.17□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 M0R378 163 aa9.17□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 IGKV2D-28P01615 120 aa9.17□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 NDUFC2O95298 119 aa9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 SPANXCQ9NY87 97 aa9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM238C9JI98 176 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-206ENST00000526095 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-206ENST00000526095 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-206ENST00000526095 NCR3O14931 201 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-206ENST00000526095 PRLHP81277 87 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-206ENST00000526095 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-206ENST00000526095 PYY3Q5JQD4 70 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-206ENST00000526095 Q6ZVH6 145 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms