RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 CEND1Q8N111 149 aa10.02□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00308Q8TCZ7 52 aa10.02□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 K7ERJ3 54 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP10-2P60368 255 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1W2PPM0 123 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 SPANXDQ9BXN6 97 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 SPANXCQ9NY87 97 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 TIMM17BO60830 172 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 A4D1N5 150 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 CHTF8P0CG12 524 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 GAGE2BQ13066 116 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 SFTA2Q6UW10 78 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 FAM168BA1KXE4 195 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 FABP2P12104 132 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 PANO1I0J062 215 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 C14orf177Q52M58 125 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-206ENST00000517323 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
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TRPS1-206ENST00000517323 COX17Q14061 63 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 RAB37Q96AX2 223 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 SCGB1A1P11684 91 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 TAL2Q16559 108 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 NCR3O14931 201 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 CFC1BP0CG36 223 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 CFC1P0CG37 223 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV2D-28P01615 120 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
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TRPS1-206ENST00000517323 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 F8WDY8 70 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 H7C2G1 150 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 IFITM1P13164 125 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 SIGMAR1Q99720 223 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-206ENST00000517323 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 HAMPP81172 84 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.9□□□□□ -0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.85□□□□□ -0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1B0GV72 72 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 A6NJY4 79 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP10-1P60331 282 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 DPH3Q96FX2 82 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1B0GWB2 263 aa9.83□□□□□ -0.84
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TRPS1-206ENST00000517323 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1B0GVY2 172 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 TSPAN13O95857 204 aa9.81□□□□□ -0.84
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TRPS1-206ENST00000517323 COPS9Q8WXC6 57 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.8□□□□□ -0.84
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TRPS1-206ENST00000517323 C22orf24Q9Y442 160 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 Q1RN00 199 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 C7orf33Q8WU49 177 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFC2O95298 119 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 SVIPQ8NHG7 77 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 A0A087WYN8 130 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 H3BMG7 143 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 M0QXV9 152 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-206ENST00000517323 ETDBQ3ZM63 59 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00167Q96N53 147 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.76□□□□□ -0.85
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