RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 Q8NDZ9 215 aa10.34□□□□□ -0.75
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 COX17Q14061 63 aa10.33□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 SMCO4Q9NRQ5 59 aa10.33□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 CBLN2Q8IUK8 224 aa10.32□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 PPDPFQ9H3Y8 114 aa10.32□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 NDUFA6P56556 154 aa10.31□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 A0A096LNJ9 63 aa10.3□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 S100PP25815 95 aa10.3□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 RHEBQ15382 184 aa10.3□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.3□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.29□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.28□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 COX19Q49B96 90 aa10.28□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.28□□□□□ -0.76
ITGA3-215ENST00000515147 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.26□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 SPRR4Q96PI1 79 aa10.26□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.26□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 SFTA2Q6UW10 78 aa10.25□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 C11orf86A6NJI1 115 aa10.24□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 COLCA2A8K830 154 aa10.24□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00158P58513 81 aa10.23□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 PMCHL1Q16048 86 aa10.23□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.23□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 HBDP02042 147 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00614P0C842 121 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 BAGE3Q86Y29 109 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 C18orf32Q8TCD1 76 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 CRCT1Q9UGL9 99 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.21□□□□□ -0.77
ITGA3-215ENST00000515147 A0A0U1RRA0 63 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 DAND5Q8N907 189 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 Q8NBF4 154 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00337Q8N6G1 96 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 YPEL4Q96NS1 127 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 PRYO14603 147 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 SPRR1AP35321 89 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 SMCR5Q8TEV8 140 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM223A0PJW6 202 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 SMIM13P0DJ93 91 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 SPINK1P00995 79 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 KCNQ1DNQ9H478 68 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 NCR3O14931 201 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 FSIP2Q5CZC0 6907 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00483Q53H64 154 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 GAGE2AQ6NT46 116 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-215ENST00000515147 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 HERV-K104P63124 156 aa10.07□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 IFI27L1Q96BM0 104 aa10.07□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa10.06□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 B5MCH6 92 aa10.06□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 ERC2-IT1O76042 136 aa10.06□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 MOBPQ13875 183 aa10.06□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 Q8N377 158 aa10.06□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 LCE2CQ5TA81 110 aa10.05□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.05□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 C5orf52A6NGY3 159 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00587B1AMM8 73 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 S100A6P06703 90 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 S100A12P80511 92 aa10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-215ENST00000515147 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 FAM19A2Q8N3H0 131 aa10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 Q9BRP9 147 aa10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 SLC25A20O43772 301 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 DDTP30046 118 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 ARL17AQ8IVW1 177 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 TRGC2P03986 189 aa9.99□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 Q6ZRX8 168 aa9.99□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 XP32Q5T750 250 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H2BKO60814 126 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H2BJP06899 126 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H2BOP23527 126 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H2BBP33778 126 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H2BDP58876 126 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms