RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
ZBED3-203ENST00000511587 NDUFA5Q16718 116 aa13.25□□□□□ -0.29
ZBED3-203ENST00000511587 M0R378 163 aa13.24□□□□□ -0.29
ZBED3-203ENST00000511587 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa13.23□□□□□ -0.29
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM223A0PJW6 202 aa13.23□□□□□ -0.29
ZBED3-203ENST00000511587 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa13.23□□□□□ -0.29
ZBED3-203ENST00000511587 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
ZBED3-203ENST00000511587 IFI27L1Q96BM0 104 aa13.2□□□□□ -0.3
ZBED3-203ENST00000511587 LINC00158P58513 81 aa13.18□□□□□ -0.3
ZBED3-203ENST00000511587 LINC00304Q8N9R0 145 aa13.16□□□□□ -0.3
ZBED3-203ENST00000511587 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.16□□□□□ -0.3
ZBED3-203ENST00000511587 A0A0U1RRA0 63 aa13.15□□□□□ -0.3
ZBED3-203ENST00000511587 MUC2Q02817 5179 aa13.15□□□□□ -0.3
ZBED3-203ENST00000511587 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.14□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 CBLN2Q8IUK8 224 aa13.13□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 SMIM13P0DJ93 91 aa13.12□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 FAM19A2Q8N3H0 131 aa13.12□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 HSBP1O75506 76 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 RETNLBQ9BQ08 111 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 HIGD2AQ9BW72 106 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 HERV-K104P63124 156 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 CTAG1AP78358 180 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 C3orf22Q8N5N4 141 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED3-203ENST00000511587 MEIG1Q5JSS6 88 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 PRYO14603 147 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 SPRR1AP35321 89 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 LINC00310P59036 64 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 SPRR4Q96PI1 79 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 ATP6V1G1O75348 118 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 TRGC2P03986 189 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 KCNQ1DNQ9H478 68 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 NCR3O14931 201 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 TSPEAR-AS2P59090 65 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 LINC00587B1AMM8 73 aa13.03□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 LINC00337Q8N6G1 96 aa13.03□□□□□ -0.32
ZBED3-203ENST00000511587 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa13.02□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 H0Y8G0 127 aa13.02□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 SERF1AO75920 110 aa13.02□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 LEPROTL1O95214 131 aa13.02□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 TPRXLQ17RH7 258 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa13□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 ARL17AQ8IVW1 177 aa13□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 LEPROTO15243 131 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa12.97□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 PLNP26678 52 aa12.97□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 SPAG11AQ6PDA7 123 aa12.97□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 SMCR5Q8TEV8 140 aa12.97□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 DAND5Q8N907 189 aa12.96□□□□□ -0.33
ZBED3-203ENST00000511587 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa12.95□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 MUC17Q685J3 4493 aa12.94□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 J3QQQ9 107 aa12.94□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 HSPB8Q9UJY1 196 aa12.94□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 A0A0U1RQV1 116 aa12.93□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 DPM2O94777 84 aa12.93□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 LINC00483Q53H64 154 aa12.93□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.92□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 PMCHL2Q9BQD1 86 aa12.92□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 CDIP1Q9H305 208 aa12.92□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 B5MCH6 92 aa12.91□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 FABP4P15090 132 aa12.91□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 NMUP48645 174 aa12.91□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 COLCA2A8K830 154 aa12.9□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 IGKCP01834 107 aa12.9□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 DDTP30046 118 aa12.9□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 HERVK_113P61574 105 aa12.9□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 Q8NBF4 154 aa12.9□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.9□□□□□ -0.34
ZBED3-203ENST00000511587 S100A12P80511 92 aa12.89□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 ERC2-IT1O76042 136 aa12.87□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 NDUFC2O95298 119 aa12.86□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.86□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.86□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 Q9BRP9 147 aa12.86□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 IGLV6-57P01721 117 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 GAGE2AQ6NT46 116 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 Q6ZRX8 168 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa12.84□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 MIEN1Q9BRT3 115 aa12.84□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 FAT4Q6V0I7 4981 aa12.83□□□□□ -0.35
ZBED3-203ENST00000511587 A0A0J9YXY3 114 aa12.82□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 SPINK1P00995 79 aa12.82□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 E9PLD3 99 aa12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 MOBPQ13875 183 aa12.79□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa12.79□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 S100A7L2Q5SY68 101 aa12.79□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.78□□□□□ -0.36
ZBED3-203ENST00000511587 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms