RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492560.6

TBXAS1-218, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene TBXAS1, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-218ENST00000492560 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.54□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.53□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 A0A0B4J2C4 111 aa6.53□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.53□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 CRPP02741 224 aa6.53□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 PMVKQ15126 192 aa6.53□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.53□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.53□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.53□□□□□ -1.36
TBXAS1-218ENST00000492560 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.52□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 PSMB2P49721 201 aa6.52□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 CARD19Q96LW7 228 aa6.52□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 IGIPA6NJ69 53 aa6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.51□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.5□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 VCYO14598 125 aa6.5□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 LEPROTO15243 131 aa6.5□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 TCL1BO95988 128 aa6.5□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 MT-ATP8P03928 68 aa6.5□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.5□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.5□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 PRR34Q9NV39 138 aa6.5□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.49□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 SLPIP03973 132 aa6.49□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 CFC1BP0CG36 223 aa6.49□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 CFC1P0CG37 223 aa6.49□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 REG3AQ06141 175 aa6.49□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 MIAQ16674 131 aa6.49□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 KIR2DL4Q99706 377 aa6.49□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.49□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 TMEM243Q9BU79 118 aa6.49□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.48□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.48□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.48□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 SLC25A20O43772 301 aa6.48□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.48□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 AMELXQ99217 191 aa6.48□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.48□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.47□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 J3QQQ9 107 aa6.47□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 TSHBP01222 138 aa6.47□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 ATXN8Q156A1 80 aa6.47□□□□□ -1.37
TBXAS1-218ENST00000492560 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 TMEM223A0PJW6 202 aa6.46□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 H3BT86 120 aa6.46□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 UBE2L6O14933 153 aa6.46□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 COX6A2Q02221 97 aa6.46□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 GAGE2BQ13066 116 aa6.46□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 GAGE2EQ4V326 116 aa6.46□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.46□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.45□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 A0A1B0GUV1 79 aa6.45□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 SNCGO76070 127 aa6.45□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 Q6ZRP5 223 aa6.44□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 SPANXCQ9NY87 97 aa6.44□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.44□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 A0A0J9YXY3 114 aa6.43□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 A4D1N5 150 aa6.43□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 C9JAW5 83 aa6.43□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 TIMM17BO60830 172 aa6.43□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.43□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.43□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.43□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.42□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 IFITM1P13164 125 aa6.42□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 IMUPQ9GZP8 106 aa6.42□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 ACYP1P07311 99 aa6.41□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 COX6CP09669 75 aa6.41□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.41□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 C15orf56Q8N910 161 aa6.41□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.4□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 I3L3M4 83 aa6.4□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TBXAS1-218ENST00000492560 A0A096LNI7 61 aa6.39□□□□□ -1.39
TBXAS1-218ENST00000492560 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.39□□□□□ -1.39
TBXAS1-218ENST00000492560 COPS9Q8WXC6 57 aa6.39□□□□□ -1.39
TBXAS1-218ENST00000492560 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.39□□□□□ -1.39
TBXAS1-218ENST00000492560 TMEM126AQ9H061 195 aa6.39□□□□□ -1.39
TBXAS1-218ENST00000492560 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.38□□□□□ -1.39
TBXAS1-218ENST00000492560 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms