RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491670.1

CEP85-208, Transcript of centrosomal protein 85, human

TSL 2

Gene CEP85, Length 941 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP85-208	ENST00000491670	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	CXCL5	P42830	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	AMELX	Q99217	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670		Q8IZM0	81 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	NMU	P48645	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670		E9PLD3	99 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	COX8A	P10176	69 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	PFN2	P35080	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670		H3BS24	57 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	DLEU1	O43261	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	DDT	P30046	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	UBE2A	P49459	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP85-208	ENST00000491670	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670		H0Y9J4	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670		M0R143	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	LEPROT	O15243	131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670		J3QQQ9	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	LINC00158	P58513	81 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	HERV-K104	P63124	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670		A0A0U1RRA0	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	ZNF861P	O60384	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	HSD52	Q0P140	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	PRR4	Q16378	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	TAL2	Q16559	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670		Q6ZVH6	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670		A6NDN8	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	BCE1	O60756	84 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	TSPAN13	O95857	204 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CEP85-208	ENST00000491670	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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