RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491264.5

HOXB-AS3-213, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 478 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIST1H2BDP58876 126 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIST1H2BCP62807 126 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HERV-K104P63124 156 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIST2H2BEQ16778 126 aa12.01□□□□□ -0.49
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIST1H2BHQ93079 126 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIST1H2BNQ99877 126 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIST1H2BMQ99879 126 aa12.01□□□□□ -0.49
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.92□□□□□ -0.5
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 TMEM126AQ9H061 195 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TMEM238C9JI98 176 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PET117Q6UWS5 81 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-213ENST00000491264 E9PLD3 99 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NCR3O14931 201 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-213ENST00000491264 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 DAND5Q8N907 189 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KRTDAPP60985 99 aa11.83□□□□□ -0.52
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 PRLHP81277 87 aa11.83□□□□□ -0.52
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 C3orf79P0CE67 100 aa11.81□□□□□ -0.52
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 CRYGAP11844 174 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-213ENST00000491264 A0A0J9YXY3 114 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.76□□□□□ -0.53
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 AKR1D1P51857 326 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NPC2P61916 151 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-213ENST00000491264 A0A087X002 238 aa11.73□□□□□ -0.53
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-213ENST00000491264 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.73□□□□□ -0.53
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ATOH7Q8N100 152 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-213ENST00000491264 IGLV6-57P01721 117 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LITAFQ99732 161 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SPANXCQ9NY87 97 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TSPAN13O95857 204 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.63□□□□□ -0.55
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