RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-1.11□□□□□ -2.59
ITGA4-211ENST00000490435 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.11□□□□□ -2.59
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ITGA4-211ENST00000490435 LINC00474Q9P2X8 69 aa-1.11□□□□□ -2.59
ITGA4-211ENST00000490435 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
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ITGA4-211ENST00000490435 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-1.2□□□□□ -2.6
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ITGA4-211ENST00000490435 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-1.23□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 S100A12P80511 92 aa-1.23□□□□□ -2.61
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ITGA4-211ENST00000490435 PP6455Q8WZ26 134 aa-1.23□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-1.23□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-1.23□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-1.23□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 LCE6AA0A183 80 aa-1.24□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1.24□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 AKAIN1P0CW23 69 aa-1.24□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2D3P61077 147 aa-1.24□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2D2P62837 147 aa-1.24□□□□□ -2.61
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