RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 LINC00158P58513 81 aa11.82□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 HIST1H2BDP58876 126 aa11.82□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 HIST1H2BCP62807 126 aa11.82□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.82□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.82□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 HIST1H2BNQ99877 126 aa11.82□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.82□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.82□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.81□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.8□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 IGKV2D-28P01615 120 aa11.8□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 SMIM13P0DJ93 91 aa11.8□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 PLNP26678 52 aa11.79□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.79□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 DPM2O94777 84 aa11.78□□□□□ -0.52
C1orf61-220ENST00000489918 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.77□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.76□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 LEPROTO15243 131 aa11.76□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.76□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 IGKCP01834 107 aa11.75□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 HERV-K104P63124 156 aa11.75□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.75□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.75□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.74□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 TMEM238C9JI98 176 aa11.74□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.73□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 J3QQQ9 107 aa11.72□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 ATP6V1G1O75348 118 aa11.72□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 UBE2AP49459 152 aa11.72□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 TMEM126AQ9H061 195 aa11.72□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 HERVK_113P61574 105 aa11.71□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.71□□□□□ -0.53
C1orf61-220ENST00000489918 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa11.7□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 M0R378 163 aa11.7□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 PRLHP81277 87 aa11.7□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 DAND5Q8N907 189 aa11.69□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 LINC00587B1AMM8 73 aa11.68□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.68□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 NCR3O14931 201 aa11.67□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.67□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.67□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 A0A087X002 238 aa11.66□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 NMUP48645 174 aa11.66□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 LINC01545Q5VT33 79 aa11.65□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 LRP2P98164 4655 aa11.65□□□□□ -0.54
C1orf61-220ENST00000489918 E9PLD3 99 aa11.64□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 C3orf79P0CE67 100 aa11.62□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 PET117Q6UWS5 81 aa11.62□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.61□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.61□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.6□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 A0A0J9YXY3 114 aa11.6□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.6□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 CRYGAP11844 174 aa11.6□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 PRYO14603 147 aa11.59□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.59□□□□□ -0.55
C1orf61-220ENST00000489918 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 KRTDAPP60985 99 aa11.58□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.58□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.58□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.58□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 NPC2P61916 151 aa11.57□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.57□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 SPRR1AP35321 89 aa11.56□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.56□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.55□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.55□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.54□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.53□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.53□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 LITAFQ99732 161 aa11.53□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
C1orf61-220ENST00000489918 DDTP30046 118 aa11.52□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 NDUFC2O95298 119 aa11.51□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 TSPAN13O95857 204 aa11.51□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 S100A1P23297 94 aa11.51□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 LPAP08519 4548 aa11.5□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.5□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF815PA8K554 130 aa11.5□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 ATOH7Q8N100 152 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 SPRR4Q96PI1 79 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 IGLV6-57P01721 117 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 C20orf202A1L168 122 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 B5MCH6 92 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 TIMM17BO60830 172 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 S100A12P80511 92 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf61-220ENST00000489918 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf61-220ENST00000489918 PRR4Q16378 134 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms