RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483282.1

C1orf43-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf43, Length 456 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-208ENST00000483282 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
C1orf43-208ENST00000483282 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 C4orf26Q17RF5 130 aa5.71□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.71□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.71□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.71□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
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C1orf43-208ENST00000483282 DEFB130BP0DP73 79 aa5.7□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 DEFB130AP0DP74 79 aa5.7□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.7□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 NOTCH2Q04721 2471 aa5.69□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.69□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.69□□□□□ -1.5
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C1orf43-208ENST00000483282 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 Q1T7F1 81 aa5.68□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 C1orf195Q5TG92 126 aa5.68□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.68□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 A0A0U1RQV1 116 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 LCE6AA0A183 80 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 MP68P56378 58 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 HILS1P60008 231 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 LINC01006Q8NI28 216 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 RMI2Q96E14 147 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 OCR1Q9BZK8 76 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.67□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 hDV103S1A0JD37 113 aa5.66□□□□□ -1.5
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C1orf43-208ENST00000483282 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.66□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.66□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.66□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 TACC2O95359 2948 aa5.65□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.65□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.65□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 PRM2P04554 102 aa5.65□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 PRR15Q8IV56 129 aa5.65□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.65□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.65□□□□□ -1.5
C1orf43-208ENST00000483282 CENPEQ02224 2701 aa5.64□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 LRBAP50851 2863 aa5.64□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.64□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 LIMD2Q9BT23 127 aa5.64□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 X6R8D5 127 aa5.64□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 ITPR2Q14571 2701 aa5.64□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 AKAP9Q99996 3911 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 HCG22E2RYF7 251 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 VPREB1P12018 145 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 SPRR4Q96PI1 79 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 AKAP6Q13023 2319 aa5.62□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.62□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 UBE2BP63146 152 aa5.62□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.61□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 J3QL48 77 aa5.61□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 IGKV4-1P06312 121 aa5.61□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 Q6ZRU5 148 aa5.61□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.61□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 BRK1Q8WUW1 75 aa5.61□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 SORL1Q92673 2214 aa5.61□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.61□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 SNURFQ9Y675 71 aa5.61□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 OXTP01178 125 aa5.6□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 Q8NBF4 154 aa5.6□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.59□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 KRTAP10-9P60411 292 aa5.59□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.59□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 KLK12Q9UKR0 248 aa5.59□□□□□ -1.51
C1orf43-208ENST00000483282 SYCNQ0VAF6 134 aa5.58□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.58□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 Q6ZRX8 168 aa5.58□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 Q6ZTC4 211 aa5.58□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 FBN2P35556 2912 aa5.58□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.58□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.58□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.58□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.57□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 TNP2Q05952 138 aa5.57□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 C1orf137Q5JT78 98 aa5.57□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 PMAIP1Q13794 54 aa5.56□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.56□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.56□□□□□ -1.52
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