RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.88□□□□□ -0.99
SOGA3-207ENST00000481848 Q1T7F1 81 aa8.88□□□□□ -0.99
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SOGA3-207ENST00000481848 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SOGA3-207ENST00000481848 JMJD1CQ15652 2540 aa8.87□□□□□ -0.99
SOGA3-207ENST00000481848 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
SOGA3-207ENST00000481848 C6orf223Q8N319 242 aa8.87□□□□□ -0.99
SOGA3-207ENST00000481848 COL4A6Q14031 1691 aa8.86□□□□□ -0.99
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SOGA3-207ENST00000481848 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
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SOGA3-207ENST00000481848 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.84□□□□□ -0.99
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SOGA3-207ENST00000481848 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.81□□□□□ -1
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SOGA3-207ENST00000481848 Q6ZRX8 168 aa8.75□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.75□□□□□ -1.01
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SOGA3-207ENST00000481848 A8MTW9 85 aa8.74□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.73□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.72□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 C19orf84I3L1E1 186 aa8.72□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.72□□□□□ -1.01
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SOGA3-207ENST00000481848 IGF2RP11717 2491 aa8.72□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 LINC00313P59037 77 aa8.71□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 LINC01006Q8NI28 216 aa8.71□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 FHL3Q13643 280 aa8.71□□□□□ -1.01
SOGA3-207ENST00000481848 Q75L30 129 aa8.7□□□□□ -1.02
SOGA3-207ENST00000481848 DMAC1Q96GE9 116 aa8.7□□□□□ -1.02
SOGA3-207ENST00000481848 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.68□□□□□ -1.02
SOGA3-207ENST00000481848 NUPR2A6NF83 97 aa8.68□□□□□ -1.02
SOGA3-207ENST00000481848 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.68□□□□□ -1.02
SOGA3-207ENST00000481848 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.66□□□□□ -1.02
SOGA3-207ENST00000481848 IGLV6-57P01721 117 aa8.66□□□□□ -1.02
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SOGA3-207ENST00000481848 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.66□□□□□ -1.02
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SOGA3-207ENST00000481848 PRO3102Q9H379 93 aa8.64□□□□□ -1.03
SOGA3-207ENST00000481848 Q6ZRU5 148 aa8.63□□□□□ -1.03
SOGA3-207ENST00000481848 C22orf24Q9Y442 160 aa8.63□□□□□ -1.03
SOGA3-207ENST00000481848 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.63□□□□□ -1.03
SOGA3-207ENST00000481848 K7EQZ3 153 aa8.62□□□□□ -1.03
SOGA3-207ENST00000481848 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SOGA3-207ENST00000481848 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SOGA3-207ENST00000481848 Q6ZRP5 223 aa8.59□□□□□ -1.03
SOGA3-207ENST00000481848 LITAFQ99732 161 aa8.59□□□□□ -1.03
SOGA3-207ENST00000481848 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.58□□□□□ -1.04
SOGA3-207ENST00000481848 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.58□□□□□ -1.04
SOGA3-207ENST00000481848 APLNQ9ULZ1 77 aa8.58□□□□□ -1.04
SOGA3-207ENST00000481848 Q6ZSN1 163 aa8.57□□□□□ -1.04
SOGA3-207ENST00000481848 CHTF8P0CG12 524 aa8.57□□□□□ -1.04
SOGA3-207ENST00000481848 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SOGA3-207ENST00000481848 CDSNQ15517 529 aa8.56□□□□□ -1.04
SOGA3-207ENST00000481848 LINC00167Q96N53 147 aa8.55□□□□□ -1.04
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SOGA3-207ENST00000481848 LINC00483Q53H64 154 aa8.55□□□□□ -1.04
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SOGA3-207ENST00000481848 H3BNG1 76 aa8.52□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 Q5XG85 94 aa8.51□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 FAM104AQ969W3 186 aa8.5□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.5□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1B0GVX0 72 aa8.5□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.5□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 C16orf90A8MZG2 172 aa8.49□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.49□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.48□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.48□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.48□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.48□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.48□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.47□□□□□ -1.05
SOGA3-207ENST00000481848 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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