RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 LEPROTO15243 131 aa14.56□□□□□ -0.08
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PTPRD-210ENST00000481079 PLEKHB2Q96CS7 222 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 UBE2BP63146 152 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 COX17Q14061 63 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 C22orf24Q9Y442 160 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 S100A2P29034 98 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRD-210ENST00000481079 DIRC1Q969H9 104 aa14.52□□□□□ -0.09
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PTPRD-210ENST00000481079 J3QQQ9 107 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00158P58513 81 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRD-210ENST00000481079 HERV-K104P63124 156 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRD-210ENST00000481079 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
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PTPRD-210ENST00000481079 E9PLD3 99 aa14.47□□□□□ -0.09
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PTPRD-210ENST00000481079 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.47□□□□□ -0.09
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PTPRD-210ENST00000481079 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa14.1□□□□□ -0.15
PTPRD-210ENST00000481079 DDTP30046 118 aa14.09□□□□□ -0.15
PTPRD-210ENST00000481079 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa14.09□□□□□ -0.15
PTPRD-210ENST00000481079 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.09□□□□□ -0.15
PTPRD-210ENST00000481079 PRYO14603 147 aa14.08□□□□□ -0.16
PTPRD-210ENST00000481079 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.08□□□□□ -0.16
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