RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 A0A096LNJ9 63 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 C11orf86A6NJI1 115 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM238C9JI98 176 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 A0A087X002 238 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 SVBPQ8N300 66 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.78□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.78□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.78□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.78□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM126AQ9H061 195 aa4.77□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 NCR3O14931 201 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 HSBP1O75506 76 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 VPREB1P12018 145 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 COX17Q14061 63 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 LPAP08519 4548 aa4.76□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM13P0DJ93 91 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM223A0PJW6 202 aa4.74□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 M0R378 163 aa4.74□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.74□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 SFTA2Q6UW10 78 aa4.74□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 Q8NDZ9 215 aa4.74□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 FABP4P15090 132 aa4.73□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.73□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.73□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.73□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.73□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 TRGC2P03986 189 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 DAND5Q8N907 189 aa4.72□□□□□ -1.65
CTPS1-209ENST00000480420 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 SERF1AO75920 110 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 LEPROTL1O95214 131 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 S100A12P80511 92 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 CDIP1Q9H305 208 aa4.71□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 MUC2Q02817 5179 aa4.7□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 HERVK_113P61574 105 aa4.7□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 NPC2P61916 151 aa4.7□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 HERV-K104P63124 156 aa4.7□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.7□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00587B1AMM8 73 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 PRYO14603 147 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 YPEL4Q96NS1 127 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 SPRR4Q96PI1 79 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 LEPROTO15243 131 aa4.68□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.68□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.68□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.68□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0U1RQV1 116 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 J3QQQ9 107 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 DPM2O94777 84 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 PLNP26678 52 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 DDTP30046 118 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 Q8NBF4 154 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 IGKCP01834 107 aa4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.65□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.65□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00310P59036 64 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 MOBPQ13875 183 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 B5MCH6 92 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 ERC2-IT1O76042 136 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 NMUP48645 174 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.62□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 COLCA2A8K830 154 aa4.62□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0J9YXY3 114 aa4.61□□□□□ -1.67
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