RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 TNXBP22105 4242 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG4B-218ENST00000479554 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG4B-218ENST00000479554 TAL2Q16559 108 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG4B-218ENST00000479554 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG4B-218ENST00000479554 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG4B-218ENST00000479554 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG4B-218ENST00000479554 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG4B-218ENST00000479554 A0A087WZ39 114 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.96□□□□□ -0.98
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ATG4B-218ENST00000479554 PTTG1IPP53801 180 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 C5orf38Q86SI9 138 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 NDUFA1O15239 70 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 GAGE2BQ13066 116 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 HIST1H4GQ99525 98 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 A0A0J9YXY3 114 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 SPAG11BQ08648 103 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 CEND1Q8N111 149 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 C2orf48Q96LS8 159 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 A6NDN8 102 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM238C9JI98 176 aa8.92□□□□□ -0.98
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ATG4B-218ENST00000479554 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
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ATG4B-218ENST00000479554 Q6ZRP5 223 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 TIMM17BO60830 172 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 HERV-K104P63124 156 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG4B-218ENST00000479554 LINC01600Q96MT4 127 aa8.9□□□□□ -0.98
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ATG4B-218ENST00000479554 RNF151Q2KHN1 245 aa8.89□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 SFTA2Q6UW10 78 aa8.89□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 REG3GQ6UW15 175 aa8.89□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.89□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1W2PNN7 141 aa8.88□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 Q6ZVH6 145 aa8.88□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 A6NJY4 79 aa8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 F8WDY8 70 aa8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 PRSS2P07478 247 aa8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 Q8IZM0 81 aa8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 SPANXCQ9NY87 97 aa8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.86□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 LITAFQ99732 161 aa8.86□□□□□ -0.99
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ATG4B-218ENST00000479554 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.85□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1B0GV90 55 aa8.84□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 TAX1BP3O14907 124 aa8.84□□□□□ -0.99
ATG4B-218ENST00000479554 IFITM1P13164 125 aa8.84□□□□□ -0.99
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ATG4B-218ENST00000479554 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.83□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 C10orf25Q5T742 122 aa8.83□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.83□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 COPS9Q8WXC6 57 aa8.83□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1B0GWB2 263 aa8.82□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 CKS1BP61024 79 aa8.82□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA0087Q14695 138 aa8.82□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.82□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.82□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 LRP2P98164 4655 aa8.81□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.81□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 KRTAP10-8P60410 259 aa8.81□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 C1orf137Q5JT78 98 aa8.81□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 FAM168BA1KXE4 195 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 A4D1N5 150 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 K7ERJ3 54 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 GAGE2EQ4V326 116 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 A0A0U1RRA0 63 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 C9orf118A6NHY6 69 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 LINC00158P58513 81 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 RAB37Q96AX2 223 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 ERG28Q9UKR5 140 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-218ENST00000479554 CFC1BP0CG36 223 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 CFC1P0CG37 223 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 C2orf82Q6UX34 121 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 DAND5Q8N907 189 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 A0A0B4J2C4 111 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 NPC2P61916 151 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 COX17Q14061 63 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 M0QXV9 152 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-218ENST00000479554 IGLV7-43P04211 117 aa8.75□□□□□ -1.01
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