RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFC2O95298 119 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 TEN1Q86WV5 123 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 C15orf56Q8N910 161 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 C22orf24Q9Y442 160 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRC-210ENST00000462363 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf223Q8N319 242 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC2BQ92478 149 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 UPK3BQ9BT76 320 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.74□□□□□ -1.81
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PTPRC-210ENST00000462363 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
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PTPRC-210ENST00000462363 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.74□□□□□ -1.81
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PTPRC-210ENST00000462363 Q1RN00 199 aa3.73□□□□□ -1.81
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PTPRC-210ENST00000462363 RNF151Q2KHN1 245 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 CASC10Q5T4H9 136 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZRU5 148 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-210ENST00000462363 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-210ENST00000462363 J3QR89 54 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-210ENST00000462363 VPS25Q9BRG1 176 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-210ENST00000462363 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-210ENST00000462363 SYCNQ0VAF6 134 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-210ENST00000462363 LECT2O14960 151 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 XGP55808 180 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00575Q6W349 94 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 Q9HAA7 133 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-210ENST00000462363 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf99Q4VX62 202 aa3.65□□□□□ -1.83
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