RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462078.1

POLR1A-205, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 469 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-205ENST00000462078 Q8NDZ9 215 aa5.71□□□□□ -1.5
POLR1A-205ENST00000462078 LPAP08519 4548 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1A-205ENST00000462078 PFN2P35080 140 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1A-205ENST00000462078 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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POLR1A-205ENST00000462078 GAGE10A6NGK3 116 aa5.68□□□□□ -1.5
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POLR1A-205ENST00000462078 COLCA2A8K830 154 aa5.67□□□□□ -1.5
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POLR1A-205ENST00000462078 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.64□□□□□ -1.51
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POLR1A-205ENST00000462078 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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POLR1A-205ENST00000462078 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.62□□□□□ -1.51
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POLR1A-205ENST00000462078 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.57□□□□□ -1.52
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POLR1A-205ENST00000462078 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.55□□□□□ -1.52
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POLR1A-205ENST00000462078 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1A-205ENST00000462078 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1A-205ENST00000462078 B5MCH6 92 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1A-205ENST00000462078 LINC00483Q53H64 154 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1A-205ENST00000462078 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1A-205ENST00000462078 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.54□□□□□ -1.52
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POLR1A-205ENST00000462078 PET117Q6UWS5 81 aa5.54□□□□□ -1.52
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