RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 NALCNQ8IZF0 1738 aa-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 A0A0G2JND7 137 aa-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 H0Y9P7 68 aa-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 H0YGG7 62 aa-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 GNGT1P63211 74 aa-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 S100A12P80511 92 aa-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 CUBNO60494 3623 aa-1.23□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.23□□□□□ -2.61
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TTC3-211ENST00000460328 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-1.23□□□□□ -2.61
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TTC3-211ENST00000460328 ARHGAP5Q13017 1502 aa-1.24□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 TMEM262E9PQX1 116 aa-1.24□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 H3BQF6 201 aa-1.24□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 HMGN1P05114 100 aa-1.24□□□□□ -2.61
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TTC3-211ENST00000460328 S100A1P23297 94 aa-1.25□□□□□ -2.61
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TTC3-211ENST00000460328 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.25□□□□□ -2.61
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TTC3-211ENST00000460328 ARMS2P0C7Q2 107 aa-1.26□□□□□ -2.61
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TTC3-211ENST00000460328 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-1.26□□□□□ -2.61
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TTC3-211ENST00000460328 PZPP20742 1482 aa-1.28□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.28□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.28□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1.28□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.28□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.28□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 H3BNG1 76 aa-1.28□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 PSMG4Q5JS54 123 aa-1.28□□□□□ -2.61
TTC3-211ENST00000460328 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-1.29□□□□□ -2.62
TTC3-211ENST00000460328 SPG11Q96JI7 2443 aa-1.29□□□□□ -2.62
TTC3-211ENST00000460328 ABCC5O15440 1437 aa-1.29□□□□□ -2.62
TTC3-211ENST00000460328 KRTDAPP60985 99 aa-1.29□□□□□ -2.62
TTC3-211ENST00000460328 MON2Q7Z3U7 1717 aa-1.29□□□□□ -2.62
TTC3-211ENST00000460328 NBASA2RRP1 2371 aa-1.29□□□□□ -2.62
TTC3-211ENST00000460328 SHPRHQ149N8 1683 aa-1.29□□□□□ -2.62
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TTC3-211ENST00000460328 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
TTC3-211ENST00000460328 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-1.3□□□□□ -2.62
TTC3-211ENST00000460328 H3BQ15 152 aa-1.3□□□□□ -2.62
TTC3-211ENST00000460328 REV3LO60673 3130 aa-1.31□□□□□ -2.62
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TTC3-211ENST00000460328 BCORQ6W2J9 1755 aa-1.31□□□□□ -2.62
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TTC3-211ENST00000460328 H7BZZ5 65 aa-1.34□□□□□ -2.62
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TTC3-211ENST00000460328 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-1.36□□□□□ -2.63
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TTC3-211ENST00000460328 KIF20BQ96Q89 1820 aa-1.36□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.37□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 TMEM218A2RU14 115 aa-1.37□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.37□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
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