RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 C4orf48Q5BLP8 95 aa14.99□□□□□ -0.01
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PBRM1-218ENST00000458294 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.97□□□□□ -0.01
PBRM1-218ENST00000458294 A0A096LNJ9 63 aa14.95□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 FABP9Q0Z7S8 132 aa14.95□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa14.95□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 CLLU1Q5K131 121 aa14.94□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa14.93□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 UQCC3Q6UW78 93 aa14.93□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM218A2RU14 115 aa14.92□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.92□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 C11orf86A6NJI1 115 aa14.91□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 LINC00158P58513 81 aa14.91□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 Q8NBF4 154 aa14.91□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 HBDP02042 147 aa14.9□□□□□ -0.02
PBRM1-218ENST00000458294 PRYO14603 147 aa14.89□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 DAND5Q8N907 189 aa14.89□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 SPINK1P00995 79 aa14.88□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 LINC00614P0C842 121 aa14.88□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.88□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 BAGE3Q86Y29 109 aa14.87□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 SEC11CQ9BY50 192 aa14.86□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 SPRR1AP35321 89 aa14.85□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 A0A0U1RRA0 63 aa14.84□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.84□□□□□ -0.03
PBRM1-218ENST00000458294 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 PMCHL1Q16048 86 aa14.83□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.83□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.82□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa14.8□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 LINC00483Q53H64 154 aa14.8□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.8□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 ATP6V1G1O75348 118 aa14.79□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa14.79□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.79□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM223A0PJW6 202 aa14.78□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 NCR3O14931 201 aa14.78□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 SMIM13P0DJ93 91 aa14.78□□□□□ -0.04
PBRM1-218ENST00000458294 RPS29P62273 56 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.76□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.76□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.76□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 RHEBQ15382 184 aa14.75□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa14.74□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.74□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 S100A12P80511 92 aa14.73□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 GAGE2AQ6NT46 116 aa14.73□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa14.72□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 HERV-K104P63124 156 aa14.72□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 MOBPQ13875 183 aa14.72□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa14.72□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 Q8N377 158 aa14.72□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.71□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 LINC00587B1AMM8 73 aa14.71□□□□□ -0.05
PBRM1-218ENST00000458294 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa14.69□□□□□ -0.06
PBRM1-218ENST00000458294 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.69□□□□□ -0.06
PBRM1-218ENST00000458294 B5MCH6 92 aa14.68□□□□□ -0.06
PBRM1-218ENST00000458294 SLC25A20O43772 301 aa14.68□□□□□ -0.06
PBRM1-218ENST00000458294 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.66□□□□□ -0.06
PBRM1-218ENST00000458294 ERC2-IT1O76042 136 aa14.65□□□□□ -0.06
PBRM1-218ENST00000458294 XP32Q5T750 250 aa14.65□□□□□ -0.06
PBRM1-218ENST00000458294 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.65□□□□□ -0.06
PBRM1-218ENST00000458294 FSIP2Q5CZC0 6907 aa14.63□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.62□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 IFITM2Q01629 132 aa14.62□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 COMMD7Q86VX2 200 aa14.62□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 Q9BRP9 147 aa14.61□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.6□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 DDTP30046 118 aa14.6□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 Q6ZRX8 168 aa14.6□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.59□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.59□□□□□ -0.07
PBRM1-218ENST00000458294 CRCT1Q9UGL9 99 aa14.58□□□□□ -0.08
PBRM1-218ENST00000458294 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PBRM1-218ENST00000458294 LCE2CQ5TA81 110 aa14.53□□□□□ -0.08
PBRM1-218ENST00000458294 C9orf153Q5TBE3 101 aa14.53□□□□□ -0.08
PBRM1-218ENST00000458294 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PBRM1-218ENST00000458294 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.5□□□□□ -0.09
PBRM1-218ENST00000458294 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.5□□□□□ -0.09
PBRM1-218ENST00000458294 IGLV6-57P01721 117 aa14.49□□□□□ -0.09
PBRM1-218ENST00000458294 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.49□□□□□ -0.09
PBRM1-218ENST00000458294 LEPROTO15243 131 aa14.48□□□□□ -0.09
PBRM1-218ENST00000458294 NDUFC2O95298 119 aa14.48□□□□□ -0.09
PBRM1-218ENST00000458294 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.46□□□□□ -0.09
PBRM1-218ENST00000458294 HSBP1O75506 76 aa14.46□□□□□ -0.09
PBRM1-218ENST00000458294 H0Y8G0 127 aa14.45□□□□□ -0.1
PBRM1-218ENST00000458294 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa14.44□□□□□ -0.1
PBRM1-218ENST00000458294 C5orf52A6NGY3 159 aa14.43□□□□□ -0.1
PBRM1-218ENST00000458294 J3QQQ9 107 aa14.43□□□□□ -0.1
PBRM1-218ENST00000458294 APOC3P02656 99 aa14.43□□□□□ -0.1
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
PBRM1-218ENST00000458294 SNAPINO95295 136 aa14.42□□□□□ -0.1
PBRM1-218ENST00000458294 NMUP48645 174 aa14.42□□□□□ -0.1
PBRM1-218ENST00000458294 PLNP26678 52 aa14.41□□□□□ -0.1
PBRM1-218ENST00000458294 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.7 ms