RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A087X002 238 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM223A0PJW6 202 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV2D-28P01615 120 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRGC2P03986 189 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM238C9JI98 176 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A0U1RRA0 63 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COX17Q14061 63 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRLHP81277 87 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSBP1O75506 76 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SERF1AO75920 110 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE2AP49459 152 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H0Y8G0 127 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 M0R378 163 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00158P58513 81 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM126AQ9H061 195 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM13P0DJ93 91 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SFTA2Q6UW10 78 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COLCA2A8K830 154 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TSPAN13O95857 204 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCGB1D1O95968 90 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRYGAP11844 174 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LEPROTL1O95214 131 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NCR3O14931 201 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FABP4P15090 132 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRR4Q16378 134 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LEPROTO15243 131 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HERV-K104P63124 156 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DAND5Q8N907 189 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP6V1G1O75348 118 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DPM2O94777 84 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLNP26678 52 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 J3QQQ9 107 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRYO14603 147 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPRR1AP35321 89 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKCP01834 107 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPRR4Q96PI1 79 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDIP1Q9H305 208 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BKO60814 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BJP06899 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BOP23527 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BBP33778 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BDP58876 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BCP62807 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00587B1AMM8 73 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HERVK_113P61574 105 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.34□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.34□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NMUP48645 174 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NPC2P61916 151 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A0J9YXY3 114 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 B5MCH6 92 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 E9PLD3 99 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERC2-IT1O76042 136 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDTP30046 118 aa8.3□□□□□ -1.08
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