RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440778.5

CCDC18-AS1-212, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SYCNQ0VAF6 134 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 BAGE3Q86Y29 109 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 STPG4Q8N801 248 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CARD19Q96LW7 228 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.91□□□□□ -1.78
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.9□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HSBP1O75506 76 aa3.9□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SPINK8P0C7L1 97 aa3.9□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 S100A1P23297 94 aa3.9□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HERVK_113P63121 156 aa3.9□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.9□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C2orf48Q96LS8 159 aa3.9□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 G0S2P27469 103 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DSCR10P59022 87 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GAGE2BQ13066 116 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GAGE2EQ4V326 116 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.89□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FAM168BA1KXE4 195 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LINC01549A6NIU2 74 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ATP5LO75964 103 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 APOMO95445 188 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FABP4P15090 132 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NDUFA6P56556 154 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 Q5VSD8 79 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 Q8IZM0 81 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 A0A1W2PNN7 141 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 EPM2AB3EWF7 344 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NDUFA1O15239 70 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LEPROTL1O95214 131 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 Q6ZRP5 223 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TMEM223A0PJW6 202 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 F8VRH5 84 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 S100A6P06703 90 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SEC61GP60059 68 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 COX7B2Q8TF08 81 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.85□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SEC11AP67812 179 aa3.85□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LCE3AQ5TA76 89 aa3.85□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 Q8NDZ9 215 aa3.85□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.84□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.84□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C3orf79P0CE67 100 aa3.84□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.84□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.84□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.84□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.84□□□□□ -1.79
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 H3BRM9 83 aa3.83□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CKS1BP61024 79 aa3.83□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CTAG1AP78358 180 aa3.83□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.83□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LINC01545Q5VT33 79 aa3.83□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.83□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.82□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DPM2O94777 84 aa3.82□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGKCP01834 107 aa3.81□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PLNP26678 52 aa3.81□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CXCL5P42830 114 aa3.81□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KRTDAPP60985 99 aa3.81□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 Q75L30 129 aa3.81□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.81□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.81□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ERG28Q9UKR5 140 aa3.81□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 M0QXV9 152 aa3.8□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LEPROTO15243 131 aa3.8□□□□□ -1.8
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PFN2P35080 140 aa3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms