RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 BCE1O60756 84 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 IGKV2D-28P01615 120 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 Q8NDZ9 215 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 A0A0U1RRA0 63 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 TMEM223A0PJW6 202 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 H0Y8G0 127 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 VPREB1P12018 145 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 HSBP1O75506 76 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 A0A087X002 238 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 S100A6P06703 90 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 C5orf52A6NGY3 159 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 TMEM238C9JI98 176 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 UBE2AP49459 152 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 PRLHP81277 87 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 LINC00158P58513 81 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 COX17Q14061 63 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 SMIM13P0DJ93 91 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 TMEM126AQ9H061 195 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 LEPROTL1O95214 131 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 SFTA2Q6UW10 78 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 M0R378 163 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 TSPAN13O95857 204 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 FABP4P15090 132 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 S100A2P29034 98 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-209ENST00000439106 NCR3O14931 201 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 CRYGAP11844 174 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 PRR4Q16378 134 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 DAND5Q8N907 189 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 LEPROTO15243 131 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 C3orf79P0CE67 100 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 HERV-K104P63124 156 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 DPM2O94777 84 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 PLNP26678 52 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 KRTDAPP60985 99 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-209ENST00000439106 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 J3QQQ9 107 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 IGKCP01834 107 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 PRYO14603 147 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 HERVK_113P61574 105 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 PET117Q6UWS5 81 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 LINC01545Q5VT33 79 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 LINC00587B1AMM8 73 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 NPC2P61916 151 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 SPRR4Q96PI1 79 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 SPRR1AP35321 89 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-209ENST00000439106 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 AKR1D1P51857 326 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 MUC2Q02817 5179 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 C20orf202A1L168 122 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 NMUP48645 174 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 A0A0J9YXY3 114 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 DDTP30046 118 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 ARL17AQ8IVW1 177 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 E9PLD3 99 aa7.99□□□□□ -1.13
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