RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 ABCA4P78363 2273 aa4.83□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA0087Q14695 138 aa4.82□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.82□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 SPG11Q96JI7 2443 aa4.82□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 A0A087WSZ3 146 aa4.81□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 NBASA2RRP1 2371 aa4.81□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 SNURFQ9Y675 71 aa4.81□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.8□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 SCXQ7RTU7 201 aa4.8□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.8□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.8□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.8□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 EDN2P20800 178 aa4.79□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.79□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.78□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.78□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.78□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 FAM104AQ969W3 186 aa4.77□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 MTORP42345 2549 aa4.77□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 A8MUN3 132 aa4.77□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP10-9P60411 292 aa4.76□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 PRR15Q8IV56 129 aa4.76□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.76□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.76□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 C15orf56Q8N910 161 aa4.76□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 A0A087WVE0 104 aa4.75□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 SMIM29Q86T20 159 aa4.75□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.75□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 PMAIP1Q13794 54 aa4.75□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00313P59037 77 aa4.75□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 SPRR4Q96PI1 79 aa4.75□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.75□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.75□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.74□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.74□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.74□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 HIVEP2P31629 2446 aa4.73□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 SPRR1BP22528 89 aa4.73□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.73□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 M0R2N4 97 aa4.73□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.73□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GU69 56 aa4.73□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.73□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.73□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.72□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 IGF2RP11717 2491 aa4.72□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 ROS1P08922 2347 aa4.72□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 EPM2AB3EWF7 344 aa4.72□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GVX0 72 aa4.71□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.71□□□□□ -1.65
ALMS1-201ENST00000423048 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.71□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF861PO60384 105 aa4.71□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 ABCA1O95477 2261 aa4.7□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 RTL8CO15255 209 aa4.7□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.7□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.7□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 LY6G6CO95867 125 aa4.7□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.664e-9■■■□□ 19
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF575Q86XF7 245 aa4.69□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 Q1T7F1 81 aa4.69□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.68□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 SPRR1AP35321 89 aa4.68□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 AKAP6Q13023 2319 aa4.68□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.68□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 UQCR11O14957 56 aa4.68□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 PRM2P04554 102 aa4.68□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.68□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 AGRNO00468 2067 aa4.68□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 RETNQ9HD89 108 aa4.67□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 H7BZZ5 65 aa4.67□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 Q8N377 158 aa4.67□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.67□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 SPINK1P00995 79 aa4.66□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 PRLHP81277 87 aa4.66□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 IGFL1Q6UW32 110 aa4.66□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.66□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.65□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.65□□□□□ -1.66
ALMS1-201ENST00000423048 A0A096LNI7 61 aa4.64□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.64□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 COA5Q86WW8 74 aa4.64□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 FN1P02751 2386 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 A0A087X002 238 aa4.63□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.63□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 OCR1Q9BZK8 76 aa4.63□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 APLNQ9ULZ1 77 aa4.63□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 PLXNB1O43157 2135 aa4.62□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.62□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 F8P00451 2351 aa4.62□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.62□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms