RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa10.85□□□□□ -0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.82□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.82□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R143 59 aa10.82□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFC2O95298 119 aa10.82□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.82□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.81□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 A6NJY4 79 aa10.81□□□□□ -0.68
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TOP3BP1-201ENST00000420768 A4D1N5 150 aa10.79□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.79□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHTF8P0CG12 524 aa10.78□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa10.78□□□□□ -0.68
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FXYD2P54710 66 aa10.77□□□□□ -0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPH3Q96FX2 82 aa10.77□□□□□ -0.68
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TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8NDZ9 215 aa10.76□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM168BA1KXE4 195 aa10.75□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.75□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.75□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZSA8 131 aa10.74□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa10.73□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0B4J2C4 111 aa10.73□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PNN7 141 aa10.73□□□□□ -0.69
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TOP3BP1-201ENST00000420768 EPM2AB3EWF7 344 aa10.73□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R378 163 aa10.73□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV2D-28P01615 120 aa10.73□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa10.72□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCR3O14931 201 aa10.72□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFC1BP0CG36 223 aa10.72□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFC1P0CG37 223 aa10.72□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.72□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 C22orf24Q9Y442 160 aa10.72□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKD1P98161 4303 aa10.71□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087WYN8 130 aa10.71□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GWB2 263 aa10.71□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB37Q96AX2 223 aa10.71□□□□□ -0.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.71□□□□□ -0.69
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TOP3BP1-201ENST00000420768 M0QXV9 152 aa10.7□□□□□ -0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 BATFQ16520 125 aa10.7□□□□□ -0.7
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TOP3BP1-201ENST00000420768 S100A7L2Q5SY68 101 aa10.68□□□□□ -0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM126AQ9H061 195 aa10.68□□□□□ -0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR13C6PQ8NH95 151 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 C7orf33Q8WU49 177 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRO1854Q9UHT4 67 aa10.67□□□□□ -0.7
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CBY1Q9Y3M2 126 aa10.66□□□□□ -0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa10.65□□□□□ -0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00167Q96N53 147 aa10.65□□□□□ -0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.65□□□□□ -0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 K7ERJ3 54 aa10.65□□□□□ -0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SCXQ7RTU7 201 aa10.65□□□□□ -0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa10.63□□□□□ -0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.61□□□□□ -0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2BP63146 152 aa10.61□□□□□ -0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa10.61□□□□□ -0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNQ1DNQ9H478 68 aa10.61□□□□□ -0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa10.59□□□□□ -0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 Q1RN00 199 aa10.59□□□□□ -0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM11BQ8TCY0 68 aa10.58□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH5Q8TE73 4624 aa10.57□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPAN13O95857 204 aa10.57□□□□□ -0.72
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 XGP55808 180 aa10.56□□□□□ -0.72
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PKHD1P08F94 4074 aa10.54□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAX1BP3O14907 124 aa10.54□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 REG3GQ6UW15 175 aa10.54□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIRC1Q969H9 104 aa10.54□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR1AP35321 89 aa10.53□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10.52□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK2AP2O75956 126 aa10.52□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMB2P49721 201 aa10.52□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 C6orf99Q4VX62 202 aa10.52□□□□□ -0.72
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