RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPANXCQ9NY87 97 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERG28Q9UKR5 140 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 XCL1P47992 114 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 XGP55808 180 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM104AQ969W3 186 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAT1Q14517 4588 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TIMM17BO60830 172 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SFTA2Q6UW10 78 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C15orf56Q8N910 161 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q1RN00 199 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LITAFQ99732 161 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SS18Q15532 418 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATXN8Q156A1 80 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC01600Q96MT4 127 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NDUFA1O15239 70 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC25A20O43772 301 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPINK8P0C7L1 97 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IFITM1P13164 125 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6ZSA8 131 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q8N1X5 172 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CARD19Q96LW7 228 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C9JAW5 83 aa6.62□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.62□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.62□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDIP1Q9H305 208 aa6.62□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H7C2G1 150 aa6.61□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLPIP03973 132 aa6.61□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HERVK_113P63121 156 aa6.61□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CFAP161Q6P656 301 aa6.61□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SCXQ7RTU7 201 aa6.61□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.61□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1B0GV72 72 aa6.6□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COX7A2LO14548 114 aa6.6□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRIAP1O43715 76 aa6.6□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COX6CP09669 75 aa6.6□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q5VSD8 79 aa6.6□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.6□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COPS9Q8WXC6 57 aa6.6□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.6□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EPM2AB3EWF7 344 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRSS2P07478 247 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C5orf38Q86SI9 138 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H3BT86 120 aa6.58□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PANO1I0J062 215 aa6.58□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MALP21145 153 aa6.58□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHTF8P0CG12 524 aa6.57□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.57□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.57□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.57□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.57□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MT-ATP8P03928 68 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HERV-K104P63124 156 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPAG11BQ08648 103 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LST1O00453 97 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CKS1BP61024 79 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NPC2P61916 151 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COX6A2Q02221 97 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C2orf82Q6UX34 121 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SYCNQ0VAF6 134 aa6.54□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.54□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.53□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.53□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6ZRU5 148 aa6.53□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.53□□□□□ -1.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms