RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC25A20O43772 301 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP5-204ENST00000412806 F8WDY8 70 aa14.2□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 NCR3O14931 201 aa14.2□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 XAGE1AQ9HD64 81 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 USP17L23D6RBM5 183 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 SYCNQ0VAF6 134 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 K7ERU9 68 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAH7Q8WXX0 4024 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP5-204ENST00000412806 M0QXV9 152 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 SLPIP03973 132 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM126AQ9H061 195 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 LECT2O14960 151 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 TEN1Q86WV5 123 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 CARD19Q96LW7 228 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZRP5 223 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC01600Q96MT4 127 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 GAGE2EQ4V326 116 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF151Q2KHN1 245 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 TRACP01848 142 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 H0YGX0 51 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A087WYN8 130 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 H3BT86 120 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP5-204ENST00000412806 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 VPREB1P12018 145 aa14.07□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV6-57P01721 117 aa14.07□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 PPDPFLQ8WWR9 84 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 TLX1NBP0CAT3 122 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 PSCAO43653 123 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 C6orf99Q4VX62 202 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP5-204ENST00000412806 J3QR89 54 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TENM2Q9NT68 2774 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC32Q5I0X7 151 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 BAALC-AS2P0C853 105 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 VPS25Q9BRG1 176 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 M0R378 163 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAL4O96015 105 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 C22orf24Q9Y442 160 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP5-204ENST00000412806 GAGE2BQ13066 116 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GX51 115 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 Q8N814 137 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00167Q96N53 147 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 M0R2N4 97 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 DIRC1Q969H9 104 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM168BA1KXE4 195 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00575Q6W349 94 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 NKAPP1Q8N9T2 125 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 C14orf177Q52M58 125 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-204ENST00000412806 FBN3Q75N90 2809 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 C7orf33Q8WU49 177 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 ORMDL1Q9P0S3 153 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 hADV29S1A0JD25 119 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 COX7BP24311 80 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A096LNI7 61 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 SNCGO76070 127 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNQ1DNQ9H478 68 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 CDIP1Q9H305 208 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 C16orf90A8MZG2 172 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZR54 194 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 RPL37AP8A6NKH3 93 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00528Q8N1L1 170 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP5-204ENST00000412806 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP5-204ENST00000412806 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP5-204ENST00000412806 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms