RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.09■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 SPANXCQ9NY87 97 aa15.09■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 F8W1H4 67 aa15.09■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 PCP4P48539 62 aa15.08■□□□□ 0
CNN3-202ENST00000394202 CNBPP62633 177 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CNN3-202ENST00000394202 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa15.08■□□□□ 0
CNN3-202ENST00000394202 COX17Q14061 63 aa15.07■□□□□ 0
CNN3-202ENST00000394202 MUSTN1Q8IVN3 82 aa15.07■□□□□ 0
CNN3-202ENST00000394202 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa15.05■□□□□ 0
CNN3-202ENST00000394202 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.05■□□□□ -0
CNN3-202ENST00000394202 DNAH11Q96DT5 4516 aa15.05■□□□□ -0
CNN3-202ENST00000394202 LINC01620Q4KN68 170 aa15.04■□□□□ -0
CNN3-202ENST00000394202 Q6ZRP5 223 aa15.04■□□□□ -0
CNN3-202ENST00000394202 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.03■□□□□ -0
CNN3-202ENST00000394202 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa15.02■□□□□ -0
CNN3-202ENST00000394202 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 H3BMG7 143 aa15.02□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 XAGE1AQ9HD64 81 aa15.01□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 GAGE2EQ4V326 116 aa15□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 GAGE2DQ9UEU5 116 aa15□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 LYRM7Q5U5X0 104 aa15□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 TSPAN13O95857 204 aa14.99□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 IFITM1P13164 125 aa14.98□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.98□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 PKD1P98161 4303 aa14.98□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 A4D1N5 150 aa14.98□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 TLX1NBP0CAT3 122 aa14.98□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 CFC1BP0CG36 223 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 CFC1P0CG37 223 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 Q8NDZ9 215 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 PRO0461Q9UI25 63 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 KRTAP10-2P60368 255 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-202ENST00000394202 GAGE2BQ13066 116 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 RYR3Q15413 4870 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.93□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 J3QR89 54 aa14.92□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 A0A096LNI7 61 aa14.91□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.91□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.91□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.91□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.91□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 A0A0B4J2C4 111 aa14.9□□□□□ -0.02
CNN3-202ENST00000394202 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa14.89□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 CHTF8P0CG12 524 aa14.89□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 PSMB2P49721 201 aa14.89□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 ETDBQ3ZM63 59 aa14.89□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 COPS9Q8WXC6 57 aa14.89□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.89□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa14.87□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 IGKV2D-28P01615 120 aa14.87□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 FAM168BA1KXE4 195 aa14.87□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 C16orf90A8MZG2 172 aa14.87□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 PANO1I0J062 215 aa14.86□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.85□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.84□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa14.84□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 MTURNQ8N3F0 131 aa14.84□□□□□ -0.03
CNN3-202ENST00000394202 PKHD1P08F94 4074 aa14.83□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 TCL1BO95988 128 aa14.83□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 VPREB1P12018 145 aa14.82□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.82□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 NCR3O14931 201 aa14.82□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 NDUFC2O95298 119 aa14.82□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.82□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PNN7 141 aa14.79□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GVY2 172 aa14.78□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CNN3-202ENST00000394202 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.76□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 H7C2G1 150 aa14.75□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 M0QXV9 152 aa14.75□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 SPACA4Q8TDM5 124 aa14.74□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 KRTAP10-1P60331 282 aa14.74□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 TEN1Q86WV5 123 aa14.74□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 PKIGQ9Y2B9 76 aa14.74□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 Q1RN00 199 aa14.73□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.73□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 SIGMAR1Q99720 223 aa14.73□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 PPDPFLQ8WWR9 84 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 C22orf24Q9Y442 160 aa14.72□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 DPH3Q96FX2 82 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 FAM30AQ9NZY2 134 aa14.71□□□□□ -0.05
CNN3-202ENST00000394202 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.71□□□□□ -0.06
CNN3-202ENST00000394202 ATXN8Q156A1 80 aa14.71□□□□□ -0.06
CNN3-202ENST00000394202 NKAPP1Q8N9T2 125 aa14.71□□□□□ -0.06
CNN3-202ENST00000394202 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa14.7□□□□□ -0.06
CNN3-202ENST00000394202 M0R378 163 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.5 ms