RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 FA2HQ7L5A8 372 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.51□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 LINC01549A6NIU2 74 aa7.5□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 CTAG1AP78358 180 aa7.5□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 DAND5Q8N907 189 aa7.5□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 NDUFA6P56556 154 aa7.49□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.49□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 COX17Q14061 63 aa7.49□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.48□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.48□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 A0A0U1RRA0 63 aa7.47□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.47□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 Q8NBF4 154 aa7.47□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.47□□□□□ -1.21
CNGA3-202ENST00000393503 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.46□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 SPRR1AP35321 89 aa7.45□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.45□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 BAGE3Q86Y29 109 aa7.45□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 HBDP02042 147 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 LINC00614P0C842 121 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 S100PP25815 95 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 RHEBQ15382 184 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.44□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 SMIM13P0DJ93 91 aa7.43□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 LINC00158P58513 81 aa7.43□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.43□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM223A0PJW6 202 aa7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 NCR3O14931 201 aa7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 ERC2-IT1O76042 136 aa7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 LINC00483Q53H64 154 aa7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.42□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 PRYO14603 147 aa7.41□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 COX19Q49B96 90 aa7.41□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 LCE2CQ5TA81 110 aa7.41□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.4□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 APOC3P02656 99 aa7.4□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.4□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.4□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CNGA3-202ENST00000393503 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 Q8N377 158 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.39□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 NDUFA5Q16718 116 aa7.38□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 SFTA2Q6UW10 78 aa7.38□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 B5MCH6 92 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 SNAPINO95295 136 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 SPINK1P00995 79 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 SVBPQ8N300 66 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 Q9BRP9 147 aa7.37□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 MOBPQ13875 183 aa7.36□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.35□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.34□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.34□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 XP32Q5T750 250 aa7.34□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.34□□□□□ -1.23
CNGA3-202ENST00000393503 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.33□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 YPEL4Q96NS1 127 aa7.33□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.33□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.31□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.31□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 Q6ZRX8 168 aa7.3□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.3□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.3□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 ATP6V1G1O75348 118 aa7.29□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 DDTP30046 118 aa7.29□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 LINC00310P59036 64 aa7.29□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 HERV-K104P63124 156 aa7.29□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.29□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 MT1HP80294 61 aa7.28□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.28□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.28□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CNGA3-202ENST00000393503 SLC25A20O43772 301 aa7.27□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 IGLV6-57P01721 117 aa7.27□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.26□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.26□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 H0Y8G0 127 aa7.24□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 LEPROTO15243 131 aa7.24□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.23□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.23□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 LINC00587B1AMM8 73 aa7.22□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 J3QQQ9 107 aa7.22□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 PCOTHQ58A44 107 aa7.22□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.22□□□□□ -1.25
CNGA3-202ENST00000393503 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms