RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390394.3

TRBV20-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20-1, Length 413 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1-201ENST00000390394 PCP2Q8IVA1 136 aa6.14□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.14□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.14□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.14□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.13□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 IFITM1P13164 125 aa6.13□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.13□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.13□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.13□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 EPM2AB3EWF7 344 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 XGP55808 180 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPANXCQ9NY87 97 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM229AH3BQW9 127 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 PANO1I0J062 215 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 M0QXV9 152 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 NDUFC2O95298 119 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 C14orf144Q96I85 54 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A1W2PNN7 141 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 UBE2BP63146 152 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 DAND5Q8N907 189 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 LITAFQ99732 161 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIGD1BQ9P298 99 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 C22orf24Q9Y442 160 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 M0R378 163 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBV20-1-201ENST00000390394 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.09□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM168BA1KXE4 195 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 VPREB1P12018 145 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H4GQ99525 98 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 NPC2P61916 151 aa6.07□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 TAL2Q16559 108 aa6.07□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.07□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 HAMPP81172 84 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q8N1X5 172 aa6.06□□□□□ -1.44
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TRBV20-1-201ENST00000390394 A6NJY4 79 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 TSTD3H0UI37 97 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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TRBV20-1-201ENST00000390394 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00167Q96N53 147 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 C12orf57Q99622 126 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM126AQ9H061 195 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 GAGE10A6NGK3 116 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 NCR3O14931 201 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 DDTP30046 118 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TRBV20-1-201ENST00000390394 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 PRYO14603 147 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 HSD52Q0P140 79 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q5VSD8 79 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV2D-28P01615 120 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 C1orf137Q5JT78 98 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 REG3GQ6UW15 175 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 CEND1Q8N111 149 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 A4D1N5 150 aa6□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 A6NDN8 102 aa6□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGLV6-57P01721 117 aa6□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q8NDZ9 215 aa6□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 BCE1O60756 84 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRBV20-1-201ENST00000390394 RAB37Q96AX2 223 aa5.99□□□□□ -1.45
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