RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 SFTA2Q6UW10 78 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPINK1P00995 79 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 NDUFA6P56556 154 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q8NBF4 154 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A096LNJ9 63 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 COX19Q49B96 90 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 DAND5Q8N907 189 aa7.36□□□□□ -1.23
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TRAPPC3-201ENST00000373159 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 C11orf86A6NJI1 115 aa7.33□□□□□ -1.24
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TRAPPC3-201ENST00000373159 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TMEM218A2RU14 115 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC00483Q53H64 154 aa7.32□□□□□ -1.24
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TRAPPC3-201ENST00000373159 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 HBDP02042 147 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC00614P0C842 121 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 CLLU1Q5K131 121 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 UQCC3Q6UW78 93 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A0U1RRA0 63 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SEC11CQ9BY50 192 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TMEM223A0PJW6 202 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATP6V1G1O75348 118 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMIM13P0DJ93 91 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 PMCHL1Q16048 86 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 XP32Q5T750 250 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.28□□□□□ -1.24
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TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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TRAPPC3-201ENST00000373159 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.26□□□□□ -1.25
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TRAPPC3-201ENST00000373159 LCE2CQ5TA81 110 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.24□□□□□ -1.25
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TRAPPC3-201ENST00000373159 S100A12P80511 92 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 RHEBQ15382 184 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.22□□□□□ -1.25
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TRAPPC3-201ENST00000373159 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q6ZRX8 168 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 DDTP30046 118 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 MT1HP80294 61 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 IFITM2Q01629 132 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGLV6-57P01721 117 aa7.15□□□□□ -1.26
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TRAPPC3-201ENST00000373159 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 C5orf52A6NGY3 159 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 COMMD7Q86VX2 200 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 NDUFC2O95298 119 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCOTHQ58A44 107 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.13□□□□□ -1.27
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TRAPPC3-201ENST00000373159 LEPROTO15243 131 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 J3QQQ9 107 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPRR1BP22528 89 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 NMUP48645 174 aa7.09□□□□□ -1.27
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