RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PREX1Q8TCU6 1659 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 M0QZ58 72 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPA17Q15506 151 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM244Q5VVB8 128 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 USP32Q8NFA0 1604 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 H0Y9P7 68 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 H3BQF6 201 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 S100PP25815 95 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HSD52Q0P140 79 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TCTE3Q8IZS6 198 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR13C6PQ8NH95 151 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UQCR10Q9UDW1 63 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZFYVE9O95405 1425 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ADGRL2O95490 1459 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-2.53□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PSMG4Q5JS54 123 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CFAP53Q96M91 514 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC32Q9BV29 185 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SAR1AQ9NR31 198 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AP4S1Q9Y587 144 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ERICH2A1L162 156 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 F8WEM9 126 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SMARCA2P51531 1590 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NCS1P62166 190 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TEX14Q8IWB6 1497 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TCEAL4Q96EI5 215 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC115Q96NT0 180 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LY75O60449 1722 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DPM2O94777 84 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAPPC2P0DI81 140 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MYOM1P52179 1685 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SCN7AQ01118 1682 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CUL7Q14999 1698 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SYNJ1O43426 1573 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MYH3P11055 1940 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SMIM20Q8N5G0 67 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 THEM6Q8WUY1 208 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LEAP2Q969E1 77 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UBR3Q6ZT12 1888 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NUP188Q5SRE5 1749 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RGPD5Q99666 1765 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A1B0GX51 115 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C7orf77A4D0Y5 90 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LYNX1G3V0Z9 82 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LOC400499M0QZD8 3231 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KIF20BQ96Q89 1820 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WT1-ASQ06250 92 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SERP1Q9Y6X1 66 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SMIM23A6NLE4 172 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 YKT6O15498 198 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 S100A9P06702 114 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ACYP1P07311 99 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GNG3P63215 75 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TPM4P67936 248 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SMIM21Q3B7S5 101 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 Q56UQ5 140 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 VAMP8Q9BV40 100 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MANBALQ9NQG1 85 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DEPDC5O75140 1603 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARL11Q969Q4 196 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C12orf57Q99622 126 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LINC00474Q9P2X8 69 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GRIN2AQ12879 1464 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WIZO95785 1651 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A2ML1A8K2U0 1454 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A1W2PRE2 83 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 M0QY20 66 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PFDN1O60925 122 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGLC2P0DOY2 106 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGLC3P0DOY3 106 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TCTAP57738 103 aa-2.62□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms