RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM223A0PJW6 202 aa9.65□□□□□ -0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 UBE2BP63146 152 aa9.65□□□□□ -0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.65□□□□□ -0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 E9PLD3 99 aa9.64□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.64□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.64□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.64□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.63□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.63□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 TSPAN13O95857 204 aa9.63□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 HERVK_113P61574 105 aa9.63□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 GAGE2EQ4V326 116 aa9.63□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.63□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 H3BRM9 83 aa9.62□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 PRO1933Q9H354 126 aa9.62□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 M0QXV9 152 aa9.61□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 NDUFA1O15239 70 aa9.61□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.6□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.6□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 TSTD3H0UI37 97 aa9.6□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 COX8AP10176 69 aa9.6□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 C10orf25Q5T742 122 aa9.6□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 LEPROTO15243 131 aa9.59□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 SPINK8P0C7L1 97 aa9.59□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 NMUP48645 174 aa9.59□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.59□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.59□□□□□ -0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 F8WDY8 70 aa9.58□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 DLEU1O43261 78 aa9.58□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.58□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.58□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.58□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.58□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 C14orf144Q96I85 54 aa9.58□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.58□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.57□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 PCP2Q8IVA1 136 aa9.57□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.57□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.57□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.57□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 J3QQQ9 107 aa9.56□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.56□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.56□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF861PO60384 105 aa9.53□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 DDTP30046 118 aa9.53□□□□□ -0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.52□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF815PA8K554 130 aa9.52□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.52□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 COX7B2Q8TF08 81 aa9.51□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.5□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 Q8IZM0 81 aa9.5□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.5□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.49□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.49□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 KIAA0087Q14695 138 aa9.49□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 C2orf82Q6UX34 121 aa9.49□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.49□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 CDIP1Q9H305 208 aa9.49□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 HIGD1BQ9P298 99 aa9.49□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A087X002 238 aa9.48□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.48□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 CRYGAP11844 174 aa9.47□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 TPRXLQ17RH7 258 aa9.47□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.47□□□□□ -0.89
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A0J9YXY3 114 aa9.46□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 SFTA2Q6UW10 78 aa9.46□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.46□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 CXCL5P42830 114 aa9.45□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 HERV-K104P63124 156 aa9.45□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 C22orf24Q9Y442 160 aa9.45□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 PRSS2P07478 247 aa9.44□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.44□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 LINC00587B1AMM8 73 aa9.43□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 TIMM17BO60830 172 aa9.43□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 CTAG1AP78358 180 aa9.43□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.43□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 LITAFQ99732 161 aa9.43□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 MUC17Q685J3 4493 aa9.43□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 HSD52Q0P140 79 aa9.41□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 TAL2Q16559 108 aa9.41□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.41□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.41□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM238C9JI98 176 aa9.4□□□□□ -0.9
CLEC1B-201ENST00000298527 BCE1O60756 84 aa9.39□□□□□ -0.91
CLEC1B-201ENST00000298527 CKS1BP61024 79 aa9.39□□□□□ -0.91
CLEC1B-201ENST00000298527 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.39□□□□□ -0.91
CLEC1B-201ENST00000298527 SPANXCQ9NY87 97 aa9.39□□□□□ -0.91
CLEC1B-201ENST00000298527 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.38□□□□□ -0.91
CLEC1B-201ENST00000298527 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CLEC1B-201ENST00000298527 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CLEC1B-201ENST00000298527 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.37□□□□□ -0.91
CLEC1B-201ENST00000298527 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.37□□□□□ -0.91
CLEC1B-201ENST00000298527 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms