RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRN-201ENST00000295718 C10orf25Q5T742 122 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-201ENST00000295718 LRCOL1A6NCL2 159 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRN-201ENST00000295718 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.02□□□□□ -0.8
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PTPRN-201ENST00000295718 PRR4Q16378 134 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRN-201ENST00000295718 CELA1Q9UNI1 258 aa10.01□□□□□ -0.81
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PTPRN-201ENST00000295718 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10□□□□□ -0.81
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PTPRN-201ENST00000295718 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.91□□□□□ -0.82
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PTPRN-201ENST00000295718 LELP1Q5T871 98 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPRN-201ENST00000295718 ZFHX3Q15911 3703 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRN-201ENST00000295718 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRN-201ENST00000295718 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRN-201ENST00000295718 X6R8D5 127 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRN-201ENST00000295718 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRN-201ENST00000295718 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.82□□□□□ -0.84
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PTPRN-201ENST00000295718 Q8NDZ9 215 aa9.81□□□□□ -0.84
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PTPRN-201ENST00000295718 SYCNQ0VAF6 134 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRN-201ENST00000295718 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0J9YWU9 116 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRN-201ENST00000295718 H7BZZ5 65 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRN-201ENST00000295718 Q6ZTC4 211 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRN-201ENST00000295718 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRN-201ENST00000295718 PRYO14603 147 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRN-201ENST00000295718 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.75□□□□□ -0.85
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