RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 C3orf84H3BNL1 204 aa7.04□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 LINC00575Q6W349 94 aa7.04□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.04□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.04□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.04□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.04□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 HIVEP2P31629 2446 aa7.04□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 LY6G6DO95868 133 aa7.03□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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CLDN1-201ENST00000295522 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.03□□□□□ -1.28
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CLDN1-201ENST00000295522 GYPEP15421 78 aa7.03□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 APCP25054 2843 aa7.03□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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CLDN1-201ENST00000295522 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.01□□□□□ -1.29
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CLDN1-201ENST00000295522 NF1P21359 2839 aa7.01□□□□□ -1.29
CLDN1-201ENST00000295522 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7□□□□□ -1.29
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CLDN1-201ENST00000295522 TEX15Q9BXT5 2789 aa7□□□□□ -1.29
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CLDN1-201ENST00000295522 CXCL6P80162 114 aa7□□□□□ -1.29
CLDN1-201ENST00000295522 PMAIP1Q13794 54 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN1-201ENST00000295522 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN1-201ENST00000295522 Q8NDZ9 215 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLDN1-201ENST00000295522 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN1-201ENST00000295522 RETNQ9HD89 108 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLDN1-201ENST00000295522 C10orf25Q5T742 122 aa6.97□□□□□ -1.29
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CLDN1-201ENST00000295522 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.96□□□□□ -1.3
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CLDN1-201ENST00000295522 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.95□□□□□ -1.3
CLDN1-201ENST00000295522 COX7BP24311 80 aa6.95□□□□□ -1.3
CLDN1-201ENST00000295522 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.95□□□□□ -1.3
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CLDN1-201ENST00000295522 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.94□□□□□ -1.3
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CLDN1-201ENST00000295522 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.92□□□□□ -1.3
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CLDN1-201ENST00000295522 COX17Q14061 63 aa6.91□□□□□ -1.3
CLDN1-201ENST00000295522 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.91□□□□□ -1.3
CLDN1-201ENST00000295522 KIAA0087Q14695 138 aa6.9□□□□□ -1.3
CLDN1-201ENST00000295522 CCL24O00175 119 aa6.9□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.9□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 IGKV4-1P06312 121 aa6.89□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 Q6ZTC4 211 aa6.88□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 A8MUN3 132 aa6.88□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 OCR1Q9BZK8 76 aa6.88□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 KRTAP10-9P60411 292 aa6.88□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.88□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.87□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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CLDN1-201ENST00000295522 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 Q6YL49 198 aa6.86□□□□□ -1.31
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CLDN1-201ENST00000295522 PRO0255Q9UI72 69 aa6.86□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.85□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 A8MU10 97 aa6.85□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 IGLV6-57P01721 117 aa6.85□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 hDV103S1A0JD37 113 aa6.85□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.85□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 ITPR2Q14571 2701 aa6.85□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 A0A1B0GUV1 79 aa6.84□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 DSCR9P59020 149 aa6.84□□□□□ -1.31
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CLDN1-201ENST00000295522 PRR15Q8IV56 129 aa6.84□□□□□ -1.31
CLDN1-201ENST00000295522 ITPR3Q14573 2671 aa6.83□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 ERC2-IT1O76042 136 aa6.83□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.83□□□□□ -1.32
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CLDN1-201ENST00000295522 H3BQ85 93 aa6.82□□□□□ -1.32
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