RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 REG3GQ6UW15 175 aa7.57□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.57□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.57□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.57□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.57□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 TMEM238C9JI98 176 aa7.56□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 PRR34Q9NV39 138 aa7.56□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.56□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 A0A0B4J2C4 111 aa7.55□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 H3BMG7 143 aa7.55□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 CHTF8P0CG12 524 aa7.55□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 A0A0J9YXY3 114 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 TIMM17BO60830 172 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 LCE4AQ5TA78 99 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 PRO0461Q9UI25 63 aa7.54□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 K7ERJ3 54 aa7.53□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 RNF151Q2KHN1 245 aa7.53□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.53□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SPC25-201ENST00000282074 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.52□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 COPS9Q8WXC6 57 aa7.52□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.52□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.51□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.51□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 IFITM1P13164 125 aa7.51□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.5□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.5□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 SPANXCQ9NY87 97 aa7.5□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.49□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 H7C423 109 aa7.49□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 TSPAN13O95857 204 aa7.49□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 SLPIP03973 132 aa7.49□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 REG3AQ06141 175 aa7.49□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 CFC1BP0CG36 223 aa7.48□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 CFC1P0CG37 223 aa7.48□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 COX6A2Q02221 97 aa7.48□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 GAGE6Q13070 117 aa7.48□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.48□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.48□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 MUC2Q02817 5179 aa7.48□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 LPAP08519 4548 aa7.48□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 A0A0U1RQV1 116 aa7.47□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.47□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 CFAP161Q6P656 301 aa7.47□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.46□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.46□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 TEN1Q86WV5 123 aa7.46□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 SIGMAR1Q99720 223 aa7.46□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 ERG28Q9UKR5 140 aa7.46□□□□□ -1.21
SPC25-201ENST00000282074 HERVK_113P63121 156 aa7.46□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.46□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 FAM104AQ969W3 186 aa7.46□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.45□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 APOMO95445 188 aa7.45□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 FOXI1Q12951 378 aa7.45□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 Q6ZRP5 223 aa7.45□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.45□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.44□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 A4D1N5 150 aa7.44□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 NDUFA1O15239 70 aa7.44□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 ETDBQ3ZM63 59 aa7.44□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 LITAFQ99732 161 aa7.44□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GUV1 79 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 COX6CP09669 75 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 HERV-K104P63124 156 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 ATXN8Q156A1 80 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 SFTA2Q6UW10 78 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 MTURNQ8N3F0 131 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.43□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 TCL1BO95988 128 aa7.41□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 PSMB2P49721 201 aa7.41□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.41□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 C15orf56Q8N910 161 aa7.41□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.4□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 A0A096LNI7 61 aa7.4□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.4□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.4□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 TMEM243Q9BU79 118 aa7.4□□□□□ -1.22
SPC25-201ENST00000282074 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.39□□□□□ -1.23
SPC25-201ENST00000282074 H3BT86 120 aa7.39□□□□□ -1.23
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