RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.03□□□□□ -1.28
TTPAL-201ENST00000262605 B9D2Q9BPU9 175 aa7.03□□□□□ -1.28
TTPAL-201ENST00000262605 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.03□□□□□ -1.28
TTPAL-201ENST00000262605 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.03□□□□□ -1.28
TTPAL-201ENST00000262605 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TTPAL-201ENST00000262605 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.03□□□□□ -1.28
TTPAL-201ENST00000262605 H3BNG1 76 aa7.02□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 M0QXV9 152 aa7.02□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 MT-ATP8P03928 68 aa7.02□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.01□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.01□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 SCXQ7RTU7 201 aa7□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 LITAFQ99732 161 aa7□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 C2orf48Q96LS8 159 aa7□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 NREPQ16612 68 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 Q8N814 137 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 APCP25054 2843 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.98□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 H3BQ85 93 aa6.98□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 C3orf84H3BNL1 204 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 MUC7Q8TAX7 377 aa6.96□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 NDUFC2O95298 119 aa6.96□□□□□ -1.29
TTPAL-201ENST00000262605 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.96□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 ZANQ9Y493 2812 aa6.96□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 MAST4O15021 2626 aa6.96□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 REG3GQ6UW15 175 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 CCKP06307 115 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.94□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.94□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 C22orf24Q9Y442 160 aa6.93□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 NDUFS5O43920 106 aa6.93□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 FAM104AQ969W3 186 aa6.93□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.93□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 ITPR2Q14571 2701 aa6.93□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.92□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00643Q86TS7 51 aa6.92□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.92□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 PRLHP81277 87 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1B0GX51 115 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 XGP55808 180 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 C7orf33Q8WU49 177 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 UPK3BQ9BT76 320 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 FAM168BA1KXE4 195 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00575Q6W349 94 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 Q6ZRP5 223 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 FBN2P35556 2912 aa6.9□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 F8WDY8 70 aa6.9□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 PDE6GP18545 87 aa6.9□□□□□ -1.3
TTPAL-201ENST00000262605 PRR34Q9NV39 138 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 H0Y9J4 135 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 CASC10Q5T4H9 136 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 C15orf56Q8N910 161 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 CHTF8P0CG12 524 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00167Q96N53 147 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 BPY2O14599 106 aa6.88□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 KIAA0087Q14695 138 aa6.88□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 C1orf137Q5JT78 98 aa6.87□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 WIPF1O43516 503 aa6.87□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 PRO0461Q9UI25 63 aa6.87□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 PRYO14603 147 aa6.86□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 B5MCH6 92 aa6.86□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.86□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.86□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.84□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 NDUFB1O75438 58 aa6.84□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.84□□□□□ -1.31
TTPAL-201ENST00000262605 ATOX1O00244 68 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 RTL8CO15255 209 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 APLNQ9ULZ1 77 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 Q9BRP9 147 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 VPREB1P12018 145 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.82□□□□□ -1.32
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