RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC01546A6NGU7 62 aa8.37□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q9BRP9 147 aa8.37□□□□□ -1.07
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.36□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BRCA2P51587 3418 aa8.35□□□□□ -1.07
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q8N3U1 123 aa8.34□□□□□ -1.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.34□□□□□ -1.07
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 C20orf197Q8N268 126 aa8.3□□□□□ -1.08
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.27□□□□□ -1.09
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.24□□□□□ -1.09
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 CFAP54Q96N23 3096 aa8.14□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6ZVQ6 151 aa8.13□□□□□ -1.11
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.13□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 APLNQ9ULZ1 77 aa8.13□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 VPREB1P12018 145 aa8.12□□□□□ -1.11
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.11□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WIPF1O43516 503 aa8.11□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.11□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRO0461Q9UI25 63 aa8.11□□□□□ -1.11
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRR4Q16378 134 aa8.09□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C15orf56Q8N910 161 aa8.09□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.09□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00846Q9NV44 126 aa8.09□□□□□ -1.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A087WVE0 104 aa8.08□□□□□ -1.12
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM168BA1KXE4 195 aa8.08□□□□□ -1.12
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CR1P17927 2039 aa8.08□□□□□ -1.12
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.07□□□□□ -1.12
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C1orf195Q5TG92 126 aa8.07□□□□□ -1.12
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.07□□□□□ -1.12
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