RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.33□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 C6orf223Q8N319 242 aa6.33□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 F8W1H4 67 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 H7C2G1 150 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIAP1O43715 76 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV2D-28P01615 120 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 COX6CP09669 75 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 H3BMG7 143 aa6.31□□□□□ -1.4
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APOBEC1-201ENST00000229304 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.31□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 PRO0461Q9UI25 63 aa6.31□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF151Q2KHN1 245 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 Q9HAA7 133 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 ATXN8Q156A1 80 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 M0QXV9 152 aa6.28□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.28□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC01600Q96MT4 127 aa6.28□□□□□ -1.4
APOBEC1-201ENST00000229304 LST1O00453 97 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP10-2P60368 255 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 SYCNQ0VAF6 134 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC32Q5I0X7 151 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZRU5 148 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.26□□□□□ -1.41
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APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.26□□□□□ -1.41
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APOBEC1-201ENST00000229304 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 H0YGX0 51 aa6.25□□□□□ -1.41
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APOBEC1-201ENST00000229304 LINC01620Q4KN68 170 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.25□□□□□ -1.41
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APOBEC1-201ENST00000229304 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.24□□□□□ -1.41
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APOBEC1-201ENST00000229304 CASC10Q5T4H9 136 aa6.24□□□□□ -1.41
APOBEC1-201ENST00000229304 CARD19Q96LW7 228 aa6.24□□□□□ -1.41
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APOBEC1-201ENST00000229304 COL7A1Q02388 2944 aa6.22□□□□□ -1.41
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APOBEC1-201ENST00000229304 K7ERU9 68 aa6.21□□□□□ -1.42
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APOBEC1-201ENST00000229304 ETDBQ3ZM63 59 aa6.21□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 C14orf177Q52M58 125 aa6.21□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZRP5 223 aa6.21□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.21□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.21□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.21□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.21□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 NCR3O14931 201 aa6.2□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.2□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 TEN1Q86WV5 123 aa6.2□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 MTURNQ8N3F0 131 aa6.2□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.2□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 M0R378 163 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 PSCAO43653 123 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.18□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 J3QR89 54 aa6.18□□□□□ -1.42
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APOBEC1-201ENST00000229304 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 GAGE2EQ4V326 116 aa6.18□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.18□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.17□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.17□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.17□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 LECT2O14960 151 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 C6orf99Q4VX62 202 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00167Q96N53 147 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.15□□□□□ -1.42
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