RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.58□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.58□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM6P0DI80 62 aa13.57□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP10-2P60368 255 aa13.57□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 PCP2Q8IVA1 136 aa13.57□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 VAMP8Q9BV40 100 aa13.57□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 PKD1P98161 4303 aa13.56□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1B0GVY2 172 aa13.56□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.56□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 HSBP1L1C9JCN9 74 aa13.55□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFA1O15239 70 aa13.55□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 NMUP48645 174 aa13.55□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 SYCNQ0VAF6 134 aa13.55□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA45Q537H7 98 aa13.55□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.55□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 TP73-AS1Q9UF72 201 aa13.55□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.55□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 F8WDY8 70 aa13.54□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 CXCL5P42830 114 aa13.53□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 CKS1BP61024 79 aa13.53□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 CARD19Q96LW7 228 aa13.52□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 EREGO14944 169 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 LINC01620Q4KN68 170 aa13.5□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 DNAH5Q8TE73 4624 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF815PA8K554 130 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 COX8AP10176 69 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 RNF151Q2KHN1 245 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.49□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 C14orf144Q96I85 54 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0J9YXY3 114 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00518Q8N0U6 118 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 C12orf57Q99622 126 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG3-202ENST00000617158 HERV-K104P63124 156 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 LITAFQ99732 161 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 SFTA2Q6UW10 78 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 SDIM1Q6ZPB5 146 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 ERG28Q9UKR5 140 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 DLEU1O43261 78 aa13.43□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 S100A12P80511 92 aa13.43□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.43□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM13P0DJ93 91 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 PFN2P35080 140 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 Q6ZRP5 223 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0U1RRA0 63 aa13.4□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 PRO1933Q9H354 126 aa13.4□□□□□ -0.26
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa13.39□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 C2orf91Q6ZV80 131 aa13.39□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 PANO1I0J062 215 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP10-1P60331 282 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 MEIG1Q5JSS6 88 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 SLC25A34Q6PIV7 304 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 A0A096LNI7 61 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 TIMM17BO60830 172 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 COX17Q14061 63 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 DAND5Q8N907 189 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00158P58513 81 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 CHTF8P0CG12 524 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 GCSHP23434 173 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 SCGB1D4Q6XE38 83 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 DNAH8Q96JB1 4490 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 PTTG1IPP53801 180 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE2BQ13066 116 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE2EQ4V326 116 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 C16orf90A8MZG2 172 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00587B1AMM8 73 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 Q8NDZ9 215 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 XAGE1AQ9HD64 81 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 FAM30AQ9NZY2 134 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa13.31□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 HIGD1BQ9P298 99 aa13.31□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 PKHD1P08F94 4074 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 MIEN1Q9BRT3 115 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 SPANXDQ9BXN6 97 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 SPANXCQ9NY87 97 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 Q6ZSA8 131 aa13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms