RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 MT-ND4LP03901 98 aa4.92□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 S100A8P05109 93 aa4.92□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 IFITM2Q01629 132 aa4.92□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 C14orf177Q52M58 125 aa4.92□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 AMN1Q8IY45 258 aa4.92□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR34Q9NV39 138 aa4.92□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 F8W036 122 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 GAS8-AS1O95177 125 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 CKS2P33552 79 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2AP49459 152 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP10-1P60331 282 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 LECT2O14960 151 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 APCSP02743 223 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 ESDP10768 282 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 WFDC2Q14508 124 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 BTF3L4Q96K17 158 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 C20orf78Q9BR46 151 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 HERC2O95714 4834 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM218A2RU14 115 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PPBPP02775 128 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00614P0C842 121 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 FGF6P10767 208 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 HBBP68871 147 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 RYR1P21817 5038 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf87E5RJ46 101 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 FCER1GP30273 86 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 IMMP2LQ96T52 175 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PKHD1P08F94 4074 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PHOX2AO14813 284 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 SEC11CQ9BY50 192 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 D6R8Y8 96 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 CCL25O15444 150 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 HLA-DQA1P01909 254 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 SS18Q15532 418 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PCP2Q8IVA1 136 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 ORMDL3Q8N138 153 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 COMMD7Q86VX2 200 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PRELID3AQ96N28 172 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 YPEL4Q96NS1 127 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 HSPG2P98160 4391 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 NPYP01303 97 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB5BP61020 215 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 C15orf56Q8N910 161 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GVX0 72 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 BPY2O14599 106 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 ADCYAP1P18509 176 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 S100PP25815 95 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf195Q5TG92 126 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZSA8 131 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 DPH3Q96FX2 82 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms