RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CLLU1Q5K131 121 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1B0GW15 77 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 I3L3M4 83 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPP1R17O96001 155 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q0VG73 95 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COTL1Q14019 142 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q6ZUT4 128 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FRZBQ92765 325 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00862A6NCI5 91 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 D6R8Y8 96 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TCAPO15273 167 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MT-ND4LP03901 98 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MT1HL1P0DM35 61 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COX6A2Q02221 97 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRAP2Q96G30 205 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BTF3L4Q96K17 158 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HIST1H4GQ99525 98 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ST20Q9HBF5 79 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RNF213Q63HN8 5207 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A096LNI7 61 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 F8W036 122 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCL25O15444 150 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CRPP02741 224 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 APCSP02743 223 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PMCHP20382 165 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 S100PP25815 95 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ELOBQ15370 118 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM136Q6ZRR5 245 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM218A2RU14 115 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 XCL1P47992 114 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LCE3AQ5TA76 89 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RMI2Q96E14 147 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IMMP2LQ96T52 175 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMIM2Q9BVW6 85 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A0J9YXV3 536 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1W2PNN7 141 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HBBP68871 147 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KIAA0087Q14695 138 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COX19Q49B96 90 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q6ZRU5 148 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C5orf38Q86SI9 138 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COMMD7Q86VX2 200 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 YPEL4Q96NS1 127 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SEC11CQ9BY50 192 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A096LNJ9 63 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGIPA6NJ69 53 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBE2L6O14933 153 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPBPP02775 128 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CKS2P33552 79 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RHEBQ15382 184 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SVBPQ8N300 66 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PRELID3AQ96N28 172 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C20orf78Q9BR46 151 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 G0S2P27469 103 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AMELXQ99217 191 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.19□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC01546A6NGU7 62 aa3.19□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC01549A6NIU2 74 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms