RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.61□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 A0A1W2PNN7 141 aa8.61□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 J3QL48 77 aa8.61□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 GAGE2EQ4V326 116 aa8.61□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 Q8IZM0 81 aa8.61□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.61□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 Q6ZRP5 223 aa8.6□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 ATP5LO75964 103 aa8.59□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 TRGC2P03986 189 aa8.59□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.59□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.59□□□□□ -1.03
CTIF-207ENST00000589585 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.58□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 SPINK8P0C7L1 97 aa8.58□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 BAGE3Q86Y29 109 aa8.58□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.57□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.57□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 H3BRM9 83 aa8.57□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 FAM168BA1KXE4 195 aa8.56□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 F8VRH5 84 aa8.56□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 IGLC3P0DOY3 106 aa8.56□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 COX7B2Q8TF08 81 aa8.56□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 CXCL5P42830 114 aa8.55□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 HSBP1O75506 76 aa8.54□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.54□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 COLCA2A8K830 154 aa8.53□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.53□□□□□ -1.04
CTIF-207ENST00000589585 OXTP01178 125 aa8.52□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.52□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 C11orf86A6NJI1 115 aa8.51□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 SCO1O75880 301 aa8.51□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.51□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.51□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.51□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 SERF1AO75920 110 aa8.5□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.5□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.49□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 M0QXV9 152 aa8.49□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.49□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.49□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.48□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 H0Y8G0 127 aa8.48□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 C1orf137Q5JT78 98 aa8.48□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 LEPROTL1O95214 131 aa8.47□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 LINC00310P59036 64 aa8.47□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 UBE2BP63146 152 aa8.47□□□□□ -1.05
CTIF-207ENST00000589585 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 NUPR1O60356 82 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 PFN2P35080 140 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 FABP4P15090 132 aa8.45□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 C22orf24Q9Y442 160 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 TMEM223A0PJW6 202 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 ODF1Q14990 250 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 IGLV7-43P04211 117 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 REG3GQ6UW15 175 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 ERG28Q9UKR5 140 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 SFTA2Q6UW10 78 aa8.41□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST1H2BKO60814 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST1H2BJP06899 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 MT1HL1P0DM35 61 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST1H2BOP23527 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST1H2BBP33778 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST1H2BDP58876 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST1H2BCP62807 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-207ENST00000589585 LINC00158P58513 81 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 COX17Q14061 63 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 LINC01600Q96MT4 127 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 A0A0U1RRA0 63 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 GAGE10A6NGK3 116 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 PLNP26678 52 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-207ENST00000589585 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.37□□□□□ -1.07
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