RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.37□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XCL1P47992 114 aa11.37□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C2orf82Q6UX34 121 aa11.37□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATRQ13535 2644 aa11.37□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.37□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC00158P58513 81 aa11.37□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q8IZM0 81 aa11.37□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.36□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.35□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.35□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBE2WQ96B02 151 aa11.35□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.34□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGKV2D-28P01615 120 aa11.34□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRPP02741 224 aa11.34□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCL18P55774 89 aa11.34□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.34□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.33□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.33□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.33□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 REG3AQ06141 175 aa11.32□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRACP01848 142 aa11.31□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PFN2P35080 140 aa11.31□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LELP1Q5T871 98 aa11.31□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XGP55808 180 aa11.29□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIAA0087Q14695 138 aa11.29□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DEFB121Q5J5C9 76 aa11.29□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q8N3U1 123 aa11.29□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CXCL5P42830 114 aa11.28□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HTN3P15516 51 aa11.28□□□□□ -0.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MT-ATP8P03928 68 aa11.27□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CKS1BP61024 79 aa11.26□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.26□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.25□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COX17Q14061 63 aa11.25□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.25□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.25□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.25□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP10-11P60412 298 aa11.25□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFAP161Q6P656 301 aa11.25□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MALP21145 153 aa11.24□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRR34Q9NV39 138 aa11.24□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.23□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.22□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H0YGX0 51 aa11.22□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.22□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CMYA5Q8N3K9 4069 aa11.22□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H3BNG1 76 aa11.21□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.21□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.21□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDUFC2O95298 119 aa11.2□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLK12Q9UKR0 248 aa11.19□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.19□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RETNQ9HD89 108 aa11.19□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C22orf24Q9Y442 160 aa11.19□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ENHOQ6UWT2 76 aa11.18□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A087WYN8 130 aa11.17□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC7Q8TAX7 377 aa11.17□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPAG11BQ08648 103 aa11.16□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q9HAA7 133 aa11.16□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANK2Q01484 3957 aa11.15□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAL4O96015 105 aa11.15□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C3orf56Q8N813 242 aa11.15□□□□□ -0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0J9YWU9 116 aa11.14□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNCGO76070 127 aa11.14□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACYP1P07311 99 aa11.14□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q6ZTC4 211 aa11.14□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.13□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.13□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C10orf25Q5T742 122 aa11.12□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C6orf223Q8N319 242 aa11.12□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.12□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM126AQ9H061 195 aa11.12□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1B0GV72 72 aa11.11□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LECT2O14960 151 aa11.11□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.11□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q6Q795 121 aa11.11□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.11□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1B0GX51 115 aa11.09□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q8NDZ9 215 aa11.09□□□□□ -0.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAGE2BQ13066 116 aa11.08□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAGE2EQ4V326 116 aa11.08□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.08□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC00167Q96N53 147 aa11.08□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.08□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.07□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.07□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ESRGQ1W209 222 aa11.06□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTC32Q5I0X7 151 aa11.06□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCR3O14931 201 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms