RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 KLK12Q9UKR0 248 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 EREGO14944 169 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 HERV-K104P63124 156 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 A0A0J9YXY3 114 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 XCL1P47992 114 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 FOXI1Q12951 378 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZVH6 145 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 COX7A2LO14548 114 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3-30P01768 117 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3-33P01772 117 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 C5orf38Q86SI9 138 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 COX7B2Q8TF08 81 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 CRPP02741 224 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 PTTG1IPP53801 180 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 Q8IZM0 81 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-217ENST00000583667 CEND1Q8N111 149 aa7.99□□□□□ -1.13
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GGA3-217ENST00000583667 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.97□□□□□ -1.13
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GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GWB2 263 aa7.96□□□□□ -1.14
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GGA3-217ENST00000583667 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
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GGA3-217ENST00000583667 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.95□□□□□ -1.14
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GGA3-217ENST00000583667 A6NJY4 79 aa7.94□□□□□ -1.14
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GGA3-217ENST00000583667 COPS9Q8WXC6 57 aa7.93□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.93□□□□□ -1.14
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GGA3-217ENST00000583667 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 COX11Q9Y6N1 276 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 TAX1BP3O14907 124 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 SMIM13P0DJ93 91 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 COX17Q14061 63 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 CKS1BP61024 79 aa7.9□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 TNP2Q05952 138 aa7.9□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 CFAP161Q6P656 301 aa7.9□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 C2orf48Q96LS8 159 aa7.9□□□□□ -1.14
GGA3-217ENST00000583667 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
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GGA3-217ENST00000583667 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 ERG28Q9UKR5 140 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.88□□□□□ -1.15
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GGA3-217ENST00000583667 A4D1N5 150 aa7.87□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 C9orf118A6NHY6 69 aa7.87□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 J3QL48 77 aa7.87□□□□□ -1.15
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GGA3-217ENST00000583667 CFC1P0CG37 223 aa7.87□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 C15orf56Q8N910 161 aa7.87□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 TTC32Q5I0X7 151 aa7.86□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 C2orf82Q6UX34 121 aa7.86□□□□□ -1.15
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