RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 TNXBP22105 4242 aa6.93□□□□□ -1.3
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TOP3A-210ENST00000580713 LCE4AQ5TA78 99 aa6.93□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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TOP3A-210ENST00000580713 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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TOP3A-210ENST00000580713 SMIM6P0DI80 62 aa6.9□□□□□ -1.3
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TOP3A-210ENST00000580713 C14orf177Q52M58 125 aa6.9□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.9□□□□□ -1.3
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TOP3A-210ENST00000580713 ATOH7Q8N100 152 aa6.89□□□□□ -1.31
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.88□□□□□ -1.31
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TOP3A-210ENST00000580713 CCL25O15444 150 aa6.88□□□□□ -1.31
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TOP3A-210ENST00000580713 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.88□□□□□ -1.31
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TOP3A-210ENST00000580713 HERVK_113P63121 156 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3A-210ENST00000580713 MIAQ16674 131 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3A-210ENST00000580713 ENHOQ6UWT2 76 aa6.86□□□□□ -1.31
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TOP3A-210ENST00000580713 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.85□□□□□ -1.31
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TOP3A-210ENST00000580713 COX6A2Q02221 97 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-210ENST00000580713 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3A-210ENST00000580713 C12orf57Q99622 126 aa6.85□□□□□ -1.31
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TOP3A-210ENST00000580713 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.84□□□□□ -1.31
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TOP3A-210ENST00000580713 HERVK_113P61574 105 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 MAJINQ3KP22 176 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 STPG4Q8N801 248 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 LINC01600Q96MT4 127 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.82□□□□□ -1.32
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TOP3A-210ENST00000580713 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 SPATA45Q537H7 98 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 C5orf38Q86SI9 138 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 A0A087WZ39 114 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 SPINK8P0C7L1 97 aa6.81□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 FOXI1Q12951 378 aa6.81□□□□□ -1.32
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TOP3A-210ENST00000580713 E9PLD3 99 aa6.8□□□□□ -1.32
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TOP3A-210ENST00000580713 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 LEPROTO15243 131 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 MALP21145 153 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 NMUP48645 174 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 C7orf33Q8WU49 177 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 APOMO95445 188 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-210ENST00000580713 A0A087WYN8 130 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 J3QQQ9 107 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 CHTF8P0CG12 524 aa6.76□□□□□ -1.33
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