RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 F8WDY8 70 aa10.05□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 EREGO14944 169 aa10.05□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 CXCL5P42830 114 aa10.05□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 NMUP48645 174 aa10.05□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 CKS1BP61024 79 aa10.05□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 SPATA45Q537H7 98 aa10.05□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.05□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.04□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 NDUFA1O15239 70 aa10.04□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 SYCNQ0VAF6 134 aa10.04□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 C10orf25Q5T742 122 aa10.04□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.04□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 Q6ZRU5 148 aa10.04□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 TTTY13Q9BZ97 58 aa10.04□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.04□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 PCP2Q8IVA1 136 aa10.03□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10.03□□□□□ -0.8
CTU2-209ENST00000567316 CARD19Q96LW7 228 aa10.02□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.01□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 S100A12P80511 92 aa10.01□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.01□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 ZNF815PA8K554 130 aa10□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 SFTA2Q6UW10 78 aa10□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.99□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 COX8AP10176 69 aa9.99□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP10-2P60368 255 aa9.99□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 HERV-K104P63124 156 aa9.99□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 RNF151Q2KHN1 245 aa9.99□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 C12orf57Q99622 126 aa9.99□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 PKD1P98161 4303 aa9.98□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.98□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 C14orf144Q96I85 54 aa9.98□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 A0A0J9YXY3 114 aa9.97□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.97□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.97□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.97□□□□□ -0.81
CTU2-209ENST00000567316 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.96□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 ERG28Q9UKR5 140 aa9.96□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 DLEU1O43261 78 aa9.95□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.95□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.94□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 SMIM13P0DJ93 91 aa9.94□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 PFN2P35080 140 aa9.94□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 LINC01620Q4KN68 170 aa9.94□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.94□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.93□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.93□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.93□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.93□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 A0A0U1RRA0 63 aa9.92□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.92□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 LINC00587B1AMM8 73 aa9.92□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 LINC00158P58513 81 aa9.92□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 COX17Q14061 63 aa9.92□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 PRO1933Q9H354 126 aa9.92□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.91□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 TIMM17BO60830 172 aa9.91□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.91□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 LITAFQ99732 161 aa9.91□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.9□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 Q6ZRP5 223 aa9.9□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 PKHD1P08F94 4074 aa9.9□□□□□ -0.82
CTU2-209ENST00000567316 GCSHP23434 173 aa9.89□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.89□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 A0A096LNI7 61 aa9.88□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 GAGE2EQ4V326 116 aa9.88□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.88□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.88□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 DAND5Q8N907 189 aa9.88□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.88□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.88□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 HERC2O95714 4834 aa9.87□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 TMEM238C9JI98 176 aa9.87□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 GAGE2BQ13066 116 aa9.87□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 HIGD1BQ9P298 99 aa9.87□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 C16orf90A8MZG2 172 aa9.86□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 PTTG1IPP53801 180 aa9.86□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.86□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.86□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.86□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 SPANXCQ9NY87 97 aa9.86□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.86□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.85□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 CHTF8P0CG12 524 aa9.85□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP10-1P60331 282 aa9.85□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.85□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTU2-209ENST00000567316 TSTD3H0UI37 97 aa9.83□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 PANO1I0J062 215 aa9.83□□□□□ -0.84
CTU2-209ENST00000567316 NPC2P61916 151 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms