RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.16□□□□□ -2.06
TMOD3-210ENST00000561408 SMIM4Q8WVI0 70 aa2.16□□□□□ -2.06
TMOD3-210ENST00000561408 AP3S1Q92572 193 aa2.16□□□□□ -2.06
TMOD3-210ENST00000561408 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
TMOD3-210ENST00000561408 AP1S3Q96PC3 154 aa2.16□□□□□ -2.06
TMOD3-210ENST00000561408 SPRR4Q96PI1 79 aa2.16□□□□□ -2.06
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H4GQ99525 98 aa2.16□□□□□ -2.06
TMOD3-210ENST00000561408 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.16□□□□□ -2.06
TMOD3-210ENST00000561408 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
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TMOD3-210ENST00000561408 SNAI2O43623 268 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 UPK1BO75841 260 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 NCS1P62166 190 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 HBG1P69891 147 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 HBG2P69892 147 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 MOBPQ13875 183 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 KIAA0087Q14695 138 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 ATP6V1FQ16864 119 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.15□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.14□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 SNAPINO95295 136 aa2.14□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 STX12Q86Y82 276 aa2.14□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.14□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 VCXQ9H320 206 aa2.14□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 A0A0J9YXY3 114 aa2.13□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.13□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PPV4 95 aa2.13□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.12□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 C17orf112F2Z3M2 114 aa2.12□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 PEX7O00628 323 aa2.12□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 RGS5O15539 181 aa2.12□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 PMCHP20382 165 aa2.12□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.12□□□□□ -2.07
TMOD3-210ENST00000561408 Q6ZUT4 128 aa2.12□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 FAM236CP0DP71 79 aa2.09□□□□□ -2.07
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TMOD3-210ENST00000561408 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.07□□□□□ -2.08
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TMOD3-210ENST00000561408 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.07□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 LINC01551Q86U37 167 aa2.07□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 SCGB1C1Q8TD33 95 aa2.07□□□□□ -2.08
TMOD3-210ENST00000561408 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.07□□□□□ -2.08
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