RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556782.5

PRPF39-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF39, Length 645 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-211ENST00000556782 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.33□□□□□ -1.88
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PRPF39-211ENST00000556782 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.33□□□□□ -1.88
PRPF39-211ENST00000556782 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.33□□□□□ -1.88
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PRPF39-211ENST00000556782 A0A0J9YXV3 536 aa3.32□□□□□ -1.88
PRPF39-211ENST00000556782 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.32□□□□□ -1.88
PRPF39-211ENST00000556782 A0A1W2PNN7 141 aa3.32□□□□□ -1.88
PRPF39-211ENST00000556782 F8WDY8 70 aa3.32□□□□□ -1.88
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PRPF39-211ENST00000556782 CLLU1Q5K131 121 aa3.32□□□□□ -1.88
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PRPF39-211ENST00000556782 TMEM141Q96I45 108 aa3.32□□□□□ -1.88
PRPF39-211ENST00000556782 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
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PRPF39-211ENST00000556782 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.31□□□□□ -1.88
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PRPF39-211ENST00000556782 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.3□□□□□ -1.88
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PRPF39-211ENST00000556782 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
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PRPF39-211ENST00000556782 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.25□□□□□ -1.89
PRPF39-211ENST00000556782 LINC01549A6NIU2 74 aa3.25□□□□□ -1.89
PRPF39-211ENST00000556782 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.25□□□□□ -1.89
PRPF39-211ENST00000556782 F8VRH5 84 aa3.25□□□□□ -1.89
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PRPF39-211ENST00000556782 CXCL5P42830 114 aa3.25□□□□□ -1.89
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