RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553846.1

PRKCH-208, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-208	ENST00000553846	TMEM18	Q96B42	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	C20orf78	Q9BR46	151 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	USH2A	O75445	5202 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	BLOC1S1	P78537	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846		Q8IZM0	81 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	LINC01551	Q86U37	167 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-208	ENST00000553846	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	TCAP	O15273	167 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	PRLH	P81277	87 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	RIG	Q13278	110 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	UBE2A	P49459	152 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	AKAP14	Q86UN6	197 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	OSTC	Q9NRP0	149 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846		V9GYV3	84 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	LINC00862	A6NCI5	91 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846		F8VRH5	84 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	ADIRF	Q15847	76 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	AMELX	Q99217	191 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	SCO1	O75880	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	NPY	P01303	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	CKS2	P33552	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	CKS1B	P61024	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846		Q6ZN92	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846		M0R378	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846		D6R8Y8	96 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846		Q8N377	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846		Q8NBF4	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-208	ENST00000553846	PRSS2	P07478	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	DAND5	Q8N907	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846		A0A1B0GW15	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846		A0A1B0GXF2	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	SPINK1	P00995	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	CXCL5	P42830	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846		Q8NDZ9	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846		C9JQL5	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846		F8W036	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	S100A8	P05109	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	VPREB1	P12018	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	NPS	P0C0P6	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	RAB5A	P20339	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846		A0A1B0GVG6	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	PPBP	P02775	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	HERVK_113	P63121	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	PEA15	Q15121	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCH-208	ENST00000553846	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCH-208	ENST00000553846	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCH-208	ENST00000553846	VCX2	Q9H322	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCH-208	ENST00000553846	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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