RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 VCX2Q9H322 139 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 A0A0U1RRA0 63 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 G0S2P27469 103 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 Q6ZN92 141 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 FA2HQ7L5A8 372 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 TOMM6Q96B49 74 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 YPEL4Q96NS1 127 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 APOMO95445 188 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 CHTF8P0CG12 524 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 UBE2D1P51668 147 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 SYCNQ0VAF6 134 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 AMELXQ99217 191 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 LINC01546A6NGU7 62 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 Q75L30 129 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 ERASQ7Z444 233 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 CARD19Q96LW7 228 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 LINC00614P0C842 121 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 SPAG11BQ08648 103 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 Q6ZRU5 148 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 TIMM17AQ99595 171 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 A0A087WZ39 114 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 H0Y8G0 127 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 PMCHL1Q16048 86 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 TNXBP22105 4242 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 A0A087WYN8 130 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 A0A096LNI7 61 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 A0A0J9YXV3 536 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 C2orf48Q96LS8 159 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 A0A096LNJ9 63 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 LINC01549A6NIU2 74 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 TRGC2P03986 189 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 NDUFA6P56556 154 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 RAB5BP61020 215 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 C10orf25Q5T742 122 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 CST9LQ9H4G1 147 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-217ENST00000550044 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 HERVK_113P63121 156 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 KIAA0087Q14695 138 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 PMVKQ15126 192 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 STPG4Q8N801 248 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 COLCA2A8K830 154 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 NDUFA1O15239 70 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 SCO1O75880 301 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 HBDP02042 147 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 SEC11AP67812 179 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 C2orf82Q6UX34 121 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 PRSS2P07478 247 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 MT1HL1P0DM35 61 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 BAGE3Q86Y29 109 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PNN7 141 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 ATP5LO75964 103 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 SPINK8P0C7L1 97 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 CKS1BP61024 79 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 HERV-K104P63124 156 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-217ENST00000550044 HSBP1O75506 76 aa6.03□□□□□ -1.44
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