RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 C2orf82Q6UX34 121 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 CEND1Q8N111 149 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRR-209ENST00000549308 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRR-209ENST00000549308 C6orf223Q8N319 242 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRR-209ENST00000549308 C15orf56Q8N910 161 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM13P0DJ93 91 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRR-209ENST00000549308 PTTG1IPP53801 180 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRR-209ENST00000549308 LITAFQ99732 161 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRR-209ENST00000549308 C10orf25Q5T742 122 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRR-209ENST00000549308 C2orf48Q96LS8 159 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRR-209ENST00000549308 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRR-209ENST00000549308 A6NJY4 79 aa7.96□□□□□ -1.13
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PTPRR-209ENST00000549308 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
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PTPRR-209ENST00000549308 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRR-209ENST00000549308 SYCNQ0VAF6 134 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRR-209ENST00000549308 COX17Q14061 63 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZRU5 148 aa7.95□□□□□ -1.14
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PTPRR-209ENST00000549308 C14orf177Q52M58 125 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRR-209ENST00000549308 TENM2Q9NT68 2774 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-209ENST00000549308 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-209ENST00000549308 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
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PTPRR-209ENST00000549308 LYSTQ99698 3801 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRR-209ENST00000549308 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRR-209ENST00000549308 CFC1P0CG37 223 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRR-209ENST00000549308 SLPIP03973 132 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRR-209ENST00000549308 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 C9orf118A6NHY6 69 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 Q8N814 137 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 A0A087WTM6 91 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZRP5 223 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRR-209ENST00000549308 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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